21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1019 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1350    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1268 aa  110  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  29.87 
 
 		 783 aa  97.4  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  26.09 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1460 aa  61.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  27.91 
 
 		 933 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1805 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1921 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  23.49 
 
 		 2159 aa  51.6  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1878 aa  51.2  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 916 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1636  hypothetical protein  25.18 
 
 		 442 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 868 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  28.49 
 
 		 960 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1937 aa  47.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.27 
 
 		 944 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  34.11 
 
 		 811 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 851 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  29.29 
 
 		 891 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  29.85 
 
 		 814 aa  45.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.72 
 
 		 992 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>