122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0158 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  100 
 
 		 1142 aa  2258    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  47.09 
 
 		 1104 aa  775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  42.3 
 
 		 1441 aa  615  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  34.23 
 
 		 1363 aa  522  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1096 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  33.81 
 
 		 1476 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  33.83 
 
 		 997 aa  474  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1076 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 1114 aa  361  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1171 aa  328  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 		 852 aa  318  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1147 aa  317  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1127 aa  304  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1077 aa  288  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1051 aa  154  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1199 aa  115  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  24.84 
 
 		 747 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  28.48 
 
 		 565 aa  107  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  20.88 
 
 		 1058 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.65 
 
 		 799 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  28.16 
 
 		 521 aa  95.9  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  22.55 
 
 		 1507 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.77 
 
 		 1007 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  22.53 
 
 		 1219 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 916 aa  78.2  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  25.7 
 
 		 1044 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  28.83 
 
 		 912 aa  76.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 		 725 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1779 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 991 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30.73 
 
 		 809 aa  68.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  31.43 
 
 		 827 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  46.91 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1055 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1247 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1060 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  23.17 
 
 		 977 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 994 aa  65.1  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.27 
 
 		 1424 aa  64.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  30.06 
 
 		 717 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  37.7 
 
 		 874 aa  63.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.98 
 
 		 992 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 729 aa  63.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 2741 aa  62.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  30.34 
 
 		 532 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 		 2741 aa  62  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.92 
 
 		 1162 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1162 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  30.86 
 
 		 905 aa  60.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 828 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1241 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 846 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1711 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.43 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  34.59 
 
 		 811 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 811 aa  55.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  39.32 
 
 		 897 aa  56.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 928 aa  55.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.65 
 
 		 854 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  28.65 
 
 		 959 aa  55.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 868 aa  55.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1805 aa  54.7  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1105 aa  54.7  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 968 aa  54.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.73 
 
 		 1009 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1409 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1025 aa  53.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1054 aa  52.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1024 aa  52.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  33.1 
 
 		 891 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 1475 aa  52.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1215 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.25 
 
 		 632 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 		 1128 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 905 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  32.12 
 
 		 903 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  31.4 
 
 		 989 aa  51.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 880 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  25.94 
 
 		 2159 aa  50.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 162 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  28.74 
 
 		 595 aa  50.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 905 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  34.48 
 
 		 447 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  34.91 
 
 		 861 aa  50.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.24 
 
 		 2637 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  34.92 
 
 		 873 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  38.89 
 
 		 751 aa  49.3  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1268 aa  49.3  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 649 aa  49.3  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  30.2 
 
 		 822 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 953 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1276 aa  48.9  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  29.19 
 
 		 783 aa  48.9  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  30.5 
 
 		 893 aa  48.9  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  34 
 
 		 890 aa  48.5  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  32.43 
 
 		 814 aa  48.5  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 1365 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  31.14 
 
 		 689 aa  48.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  33.66 
 
 		 890 aa  47.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1068 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>