40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1925 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1608    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1268 aa  330  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  29.87 
 
 		 659 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  25.89 
 
 		 615 aa  87.4  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1937 aa  61.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  25.35 
 
 		 992 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1460 aa  58.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  28.67 
 
 		 1219 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 916 aa  56.2  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  30.43 
 
 		 903 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 851 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1276 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3451  hypothetical protein  26.86 
 
 		 710 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.975495  normal  0.147632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1142 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1878 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.65 
 
 		 717 aa  51.6  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.32 
 
 		 809 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  25 
 
 		 1921 aa  50.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1805 aa  51.2  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  22.93 
 
 		 2159 aa  51.2  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  29.38 
 
 		 814 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 854 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1711 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  20.71 
 
 		 884 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1060 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 		 991 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 2741 aa  48.5  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.17 
 
 		 1186 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1285 aa  47.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 2741 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.22 
 
 		 828 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.38 
 
 		 943 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1051 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  27.86 
 
 		 840 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  27.59 
 
 		 845 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1025 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1104 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 937 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  23.41 
 
 		 532 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1441 aa  44.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>