54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2575 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  100 
 
 		 1241 aa  2397    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  35.03 
 
 		 909 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1228 aa  178  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1051 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.05 
 
 		 827 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  26.61 
 
 		 521 aa  74.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 846 aa  70.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  29.39 
 
 		 565 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1104 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1077 aa  65.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1058 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 905 aa  63.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1076 aa  62.4  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1711 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1142 aa  58.9  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 916 aa  57.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  23.17 
 
 		 1219 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1096 aa  56.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  41.84 
 
 		 852 aa  56.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 994 aa  56.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  28.39 
 
 		 874 aa  55.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 		 1266 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  33.68 
 
 		 811 aa  55.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 		 2741 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  26.86 
 
 		 997 aa  54.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 		 1363 aa  53.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 2741 aa  53.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 		 1114 aa  52.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1247 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1779 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  32.23 
 
 		 992 aa  51.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1441 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  32.23 
 
 		 944 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 905 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  37.82 
 
 		 814 aa  49.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 905 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 1544 aa  49.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  29.62 
 
 		 873 aa  48.9  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 1621 aa  48.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 902 aa  48.5  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1171 aa  47.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.12 
 
 		 1009 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 1186 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1060 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  33.1 
 
 		 717 aa  47.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 729 aa  47.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 868 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.12 
 
 		 1007 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  34.91 
 
 		 643 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 868 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  36 
 
 		 897 aa  45.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 		 968 aa  45.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 880 aa  45.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.12 
 
 		 532 aa  45.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>