64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4669 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 811 aa  1556    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  38.37 
 
 		 595 aa  265  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  33.58 
 
 		 890 aa  258  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 880 aa  251  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  33.25 
 
 		 890 aa  250  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  35.66 
 
 		 883 aa  243  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  33.07 
 
 		 897 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  37.79 
 
 		 874 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  33.04 
 
 		 873 aa  200  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 902 aa  174  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  29.9 
 
 		 811 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  33.76 
 
 		 861 aa  159  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  37.2 
 
 		 751 aa  127  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  31.6 
 
 		 905 aa  127  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  32.12 
 
 		 848 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  36.77 
 
 		 814 aa  111  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  30.38 
 
 		 689 aa  107  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 916 aa  98.2  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  34.84 
 
 		 992 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  29.21 
 
 		 717 aa  72.4  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 		 2741 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 		 2741 aa  67.4  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 868 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  25.75 
 
 		 959 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  20.46 
 
 		 1060 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1460 aa  59.3  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  36.61 
 
 		 1142 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 846 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.63 
 
 		 893 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.7 
 
 		 1266 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.01 
 
 		 828 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 937 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  30.87 
 
 		 827 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  26.34 
 
 		 918 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1711 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1051 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 1621 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 1544 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  37.5 
 
 		 960 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  23.13 
 
 		 532 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.48 
 
 		 991 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.72 
 
 		 968 aa  48.5  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 994 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 919 aa  47.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 1215 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1228 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  25.42 
 
 		 909 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 796 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  33.81 
 
 		 989 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 923 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.95 
 
 		 1007 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1096 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 		 1162 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  18.72 
 
 		 884 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1162 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1147 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 		 957 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1104 aa  45.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 854 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1805 aa  44.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.32 
 
 		 706 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  24.9 
 
 		 698 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1268 aa  44.3  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>