30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5663 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  100 
 
 		 960 aa  1833    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  37.08 
 
 		 827 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  32.33 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.42 
 
 		 2741 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.16 
 
 		 2741 aa  67.4  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  35.75 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  32.29 
 
 		 717 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  33.68 
 
 		 874 aa  60.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  32.84 
 
 		 890 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 1276 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  39.53 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  34.19 
 
 		 1142 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1621 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  35.29 
 
 		 883 aa  53.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 880 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1544 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.82 
 
 		 1266 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  34.48 
 
 		 873 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 811 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 902 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  32 
 
 		 1051 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  28.79 
 
 		 595 aa  49.7  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 1114 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  42.86 
 
 		 848 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  31.86 
 
 		 890 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1711 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1104 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  31.98 
 
 		 811 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  27.15 
 
 		 903 aa  44.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1831 aa  44.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>