92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2728 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  100 
 
 		 1096 aa  2181    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  41.35 
 
 		 1104 aa  602  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  37.25 
 
 		 1142 aa  526  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 1476 aa  422  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  30.5 
 
 		 1363 aa  416  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  30.01 
 
 		 997 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1076 aa  360  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  44.62 
 
 		 1441 aa  328  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  32.01 
 
 		 1114 aa  313  9e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  29.45 
 
 		 852 aa  293  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1171 aa  270  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1077 aa  268  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1147 aa  249  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1127 aa  234  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1051 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1199 aa  118  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  29.59 
 
 		 565 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1058 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  39.02 
 
 		 747 aa  101  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  29.38 
 
 		 827 aa  85.9  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  25.53 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 1711 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 994 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  34.59 
 
 		 912 aa  68.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.26 
 
 		 717 aa  68.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 916 aa  68.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.28 
 
 		 809 aa  65.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 		 1779 aa  65.1  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  28.41 
 
 		 1219 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.57 
 
 		 1007 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  27.84 
 
 		 992 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1365 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 2741 aa  59.7  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 		 2741 aa  58.9  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1241 aa  58.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1409 aa  58.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 1276 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 868 aa  58.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  36.91 
 
 		 822 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  33.75 
 
 		 874 aa  57.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  36.89 
 
 		 897 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 937 aa  56.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  28.38 
 
 		 371 aa  56.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 846 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 1448 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 822 aa  55.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  31.15 
 
 		 905 aa  54.3  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  19.91 
 
 		 884 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1060 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.47 
 
 		 532 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 928 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 729 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.37 
 
 		 1009 aa  53.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  19.65 
 
 		 1247 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 		 1162 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  23.86 
 
 		 960 aa  52  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 854 aa  52  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1162 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1054 aa  51.6  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  27.22 
 
 		 418 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.95 
 
 		 991 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1268 aa  50.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  27.45 
 
 		 845 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.98 
 
 		 854 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  29.32 
 
 		 853 aa  50.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  31.29 
 
 		 903 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1025 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  23.81 
 
 		 944 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  29.71 
 
 		 595 aa  49.7  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1055 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  32.52 
 
 		 873 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1621 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  25.56 
 
 		 2159 aa  50.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1544 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  32.17 
 
 		 1266 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  27.09 
 
 		 840 aa  48.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 1192 aa  48.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1228 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1276 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1805 aa  46.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 851 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 811 aa  45.8  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  29.46 
 
 		 909 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  39.76 
 
 		 751 aa  45.8  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 868 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.07 
 
 		 1475 aa  45.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  34.72 
 
 		 474 aa  45.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 905 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  23.32 
 
 		 698 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  28.67 
 
 		 891 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 905 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 885 aa  44.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>