27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1021 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  929    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0693  hypothetical protein  57.01 
 
 
107 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0694  hypothetical protein  55.56 
 
 
387 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  38 
 
 
1363 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2083  hypothetical protein  29.32 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.510849 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  37.13 
 
 
997 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  39.53 
 
 
1114 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1785  hypothetical protein  48.1 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  36.29 
 
 
1476 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4349  hypothetical protein  38.26 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  51.35 
 
 
1142 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
852 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4350  hypothetical protein  37.37 
 
 
210 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  34.92 
 
 
1441 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  33.96 
 
 
1104 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1823  hypothetical protein  26.79 
 
 
435 aa  57  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  37.61 
 
 
1171 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1507  hypothetical protein  30.95 
 
 
464 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000660776  normal  0.36544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  36.03 
 
 
1076 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0254  hypothetical protein  36.73 
 
 
374 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  35.61 
 
 
1147 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2656  hypothetical protein  34.15 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0271609  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  36.62 
 
 
552 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  32.17 
 
 
1077 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  34.72 
 
 
1096 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0641  hypothetical protein  24.04 
 
 
211 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00245145  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  22.96 
 
 
1058 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>