54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6582 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  100 
 
 
1076 aa  2103    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  39.58 
 
 
1104 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  35.65 
 
 
1142 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 
1363 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
997 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 
1476 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  34.67 
 
 
1096 aa  376  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
852 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  31.51 
 
 
1127 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  32.63 
 
 
1114 aa  311  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  30.64 
 
 
1077 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  29.81 
 
 
1171 aa  245  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  31.08 
 
 
1147 aa  211  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  37.01 
 
 
1441 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  26.88 
 
 
1051 aa  116  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 
747 aa  112  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  27.32 
 
 
1199 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  28.7 
 
 
565 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  26.83 
 
 
521 aa  78.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  39.42 
 
 
912 aa  75.1  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  21.74 
 
 
1058 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  26.7 
 
 
827 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  28.63 
 
 
1241 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.81 
 
 
1162 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
1162 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  29.38 
 
 
903 aa  58.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
1060 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.94 
 
 
2741 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 
2741 aa  57.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  22.22 
 
 
1219 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
729 aa  56.2  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.15 
 
 
1007 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  27.23 
 
 
532 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  25.33 
 
 
840 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 
991 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  25.37 
 
 
717 aa  53.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  36.76 
 
 
474 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
1714 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
846 aa  51.6  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.07 
 
 
809 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  25 
 
 
1921 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  27.66 
 
 
1228 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.99 
 
 
1009 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  25.56 
 
 
845 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 
1711 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
1779 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.25 
 
 
418 aa  48.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  30.46 
 
 
1914 aa  47.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
1055 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  28.8 
 
 
877 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
916 aa  45.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
854 aa  45.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.37 
 
 
828 aa  45.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
994 aa  44.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>