32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0589 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1805 aa  762    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  100 
 
 		 1921 aa  3947    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  31.41 
 
 		 2159 aa  740    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1878 aa  634  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1460 aa  566  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1831 aa  483  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1937 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  27.42 
 
 		 933 aa  215  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  26.39 
 
 		 487 aa  93.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1060 aa  71.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.05 
 
 		 991 aa  62  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  25.91 
 
 		 697 aa  57  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1020 aa  54.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  29.34 
 
 		 432 aa  53.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  22.67 
 
 		 876 aa  53.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  22.67 
 
 		 876 aa  53.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  25.1 
 
 		 1429 aa  53.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  25.38 
 
 		 544 aa  51.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 846 aa  51.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  24.75 
 
 		 659 aa  51.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  23.2 
 
 		 689 aa  49.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4676  hypothetical protein  23.66 
 
 		 471 aa  49.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 916 aa  48.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 2741 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  24.56 
 
 		 559 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  23.99 
 
 		 525 aa  47.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1268 aa  47  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  22.48 
 
 		 569 aa  47.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  27.82 
 
 		 1363 aa  47  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  19.23 
 
 		 835 aa  46.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 796 aa  46.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 2741 aa  45.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>