107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6571 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  100 
 
 
1077 aa  2099    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  34.81 
 
 
1104 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  33 
 
 
1441 aa  332  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
1363 aa  305  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  30.43 
 
 
1096 aa  290  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
1476 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 
997 aa  267  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  30.94 
 
 
1076 aa  251  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  28 
 
 
1114 aa  241  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  36.5 
 
 
1171 aa  195  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 
852 aa  187  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  29.59 
 
 
1147 aa  184  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  34.21 
 
 
1127 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  29.4 
 
 
1199 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  31.63 
 
 
1051 aa  118  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  31.15 
 
 
1142 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  39.84 
 
 
747 aa  89.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  28.25 
 
 
521 aa  84.7  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  35.68 
 
 
565 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.12 
 
 
2741 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  34.29 
 
 
912 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  39.19 
 
 
903 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
916 aa  77  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25 
 
 
1007 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.1 
 
 
1009 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.02 
 
 
809 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 
2741 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  31.27 
 
 
827 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  31.89 
 
 
717 aa  72  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  29.9 
 
 
1241 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 
846 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 
1060 aa  68.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 
1162 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 
1162 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.61 
 
 
991 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 
854 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  35.25 
 
 
874 aa  65.1  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.66 
 
 
989 aa  64.3  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 
1711 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  29.93 
 
 
1228 aa  62.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.02 
 
 
532 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.69 
 
 
944 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
1025 aa  61.2  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
1247 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.31 
 
 
884 aa  59.7  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
994 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  25.39 
 
 
950 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  27.05 
 
 
840 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  25.39 
 
 
950 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.5 
 
 
3537 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 
854 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.48 
 
 
904 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
949 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  23.31 
 
 
1219 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  31.97 
 
 
909 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.5 
 
 
3535 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.5 
 
 
3419 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.5 
 
 
3298 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  26.21 
 
 
845 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
868 aa  55.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  34.18 
 
 
873 aa  55.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
822 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
1365 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
937 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.61 
 
 
828 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
905 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
905 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
1276 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
1409 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
729 aa  53.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
885 aa  52.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
1779 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
1276 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.76 
 
 
1328 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
868 aa  51.6  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  29.79 
 
 
1025 aa  51.6  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  28.63 
 
 
905 aa  51.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
1714 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
796 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  31.01 
 
 
1914 aa  51.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.59 
 
 
919 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  28.12 
 
 
877 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  26.23 
 
 
918 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  25.75 
 
 
447 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  26.32 
 
 
595 aa  49.3  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
1105 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  23.74 
 
 
1247 aa  49.3  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  24.15 
 
 
725 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  22.37 
 
 
1058 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
1544 aa  48.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  26.7 
 
 
891 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
880 aa  48.5  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
1054 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  24.12 
 
 
853 aa  48.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  27.71 
 
 
1024 aa  47.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 
968 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
928 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  33.03 
 
 
599 aa  47  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
851 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  30.83 
 
 
1475 aa  46.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>