142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6111 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1171    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  86.26 
 
 		 596 aa  946    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  85.82 
 
 		 724 aa  867    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  55.9 
 
 		 1141 aa  317  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  46.57 
 
 		 994 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  43.16 
 
 		 1219 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 		 1621 aa  193  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  41.72 
 
 		 1779 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 1911 aa  167  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  41.04 
 
 		 1083 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  39.86 
 
 		 560 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  36.87 
 
 		 552 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 1711 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  38.36 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.88 
 
 		 934 aa  150  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 1448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  38.7 
 
 		 1502 aa  147  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  30.17 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  40.23 
 
 		 1544 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  37.5 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  41.25 
 
 		 476 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  38.11 
 
 		 1321 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  30.87 
 
 		 992 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  31.6 
 
 		 720 aa  123  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  35.55 
 
 		 1247 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  29.41 
 
 		 982 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.47 
 
 		 644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  29.52 
 
 		 737 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 		 632 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  42.39 
 
 		 1869 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1054 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  27.57 
 
 		 720 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1119 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  22.92 
 
 		 490 aa  97.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 878 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 810 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  37.31 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  35.68 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  30.68 
 
 		 1611 aa  78.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  31.9 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  31.9 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.85 
 
 		 1694 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.11 
 
 		 732 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  33.03 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 817 aa  74.7  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  22.81 
 
 		 962 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1253  hypothetical protein  31.91 
 
 		 458 aa  73.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.238596  normal  0.0174069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  36.49 
 
 		 337 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  32.55 
 
 		 327 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  33.87 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  33.87 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.86 
 
 		 799 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  25.45 
 
 		 897 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  32.42 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 543 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.95 
 
 		 730 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  22.66 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 1279 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 685 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1864  hypothetical protein  30.81 
 
 		 682 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.837746  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 412 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  34.11 
 
 		 405 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 		 1486 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 		 1288 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.51 
 
 		 1266 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.81 
 
 		 1228 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 909 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 615 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 620 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  31.21 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.95 
 
 		 603 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 343 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 824 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.45 
 
 		 626 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.15 
 
 		 816 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 614 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 421 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.52 
 
 		 1056 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.5 
 
 		 587 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 362 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  33.12 
 
 		 412 aa  53.9  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.78 
 
 		 733 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 523 aa  53.9  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.04 
 
 		 626 aa  53.9  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 1363 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 573 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  27.65 
 
 		 932 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.07 
 
 		 1007 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 626 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 945 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 614 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 614 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 614 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1123 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 		 991 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 681 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1238 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>