210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1546 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  44.46 
 
 		 1219 aa  887    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1779 aa  3627    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  73.38 
 
 		 1321 aa  1324    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  63.14 
 
 		 1711 aa  1416    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  76.69 
 
 		 1083 aa  969    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  51.24 
 
 		 1448 aa  927    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  88.61 
 
 		 1247 aa  1707    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  58.8 
 
 		 1621 aa  1533    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  63.32 
 
 		 1544 aa  1244    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 994 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 1911 aa  488  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  32.08 
 
 		 992 aa  407  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  35.02 
 
 		 1141 aa  362  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  51.06 
 
 		 552 aa  324  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  48.84 
 
 		 393 aa  291  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.55 
 
 		 1694 aa  266  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  40.97 
 
 		 724 aa  265  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  29.02 
 
 		 934 aa  239  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.94 
 
 		 1266 aa  229  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  31.62 
 
 		 982 aa  218  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  39.89 
 
 		 599 aa  209  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  40.88 
 
 		 596 aa  204  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 878 aa  201  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 422 aa  194  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.75 
 
 		 1007 aa  172  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 1869 aa  163  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.14 
 
 		 810 aa  162  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  36.72 
 
 		 714 aa  153  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 916 aa  150  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 1502 aa  148  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1058 aa  146  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 1276 aa  144  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1276 aa  141  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 		 1288 aa  138  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  27.64 
 
 		 565 aa  138  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 		 1450 aa  136  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  31.35 
 
 		 1363 aa  136  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  24.06 
 
 		 962 aa  135  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  38.37 
 
 		 476 aa  134  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  25.9 
 
 		 1476 aa  132  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  27.04 
 
 		 985 aa  132  8.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  33.13 
 
 		 720 aa  125  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1192 aa  121  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  32.06 
 
 		 737 aa  120  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.88 
 
 		 827 aa  112  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1051 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  34.63 
 
 		 720 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  34.32 
 
 		 199 aa  110  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  26.07 
 
 		 521 aa  108  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 		 991 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 		 2741 aa  108  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.68 
 
 		 2741 aa  104  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1215 aa  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1060 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  32.74 
 
 		 322 aa  102  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  32.74 
 
 		 322 aa  102  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  31.86 
 
 		 717 aa  101  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  32.51 
 
 		 560 aa  99.4  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  34.27 
 
 		 326 aa  97.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 649 aa  95.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  28.14 
 
 		 490 aa  95.5  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.29 
 
 		 725 aa  95.5  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.76 
 
 		 733 aa  94  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  33.52 
 
 		 1131 aa  94  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.46 
 
 		 1162 aa  94  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  92.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  34.09 
 
 		 341 aa  92  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.43 
 
 		 1040 aa  91.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 1162 aa  89  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 949 aa  89  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1104 aa  88.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 868 aa  85.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 843 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 644 aa  84.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.56 
 
 		 1328 aa  84.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1238 aa  82.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.75 
 
 		 2145 aa  82.8  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  31.98 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  34.04 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  34.04 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  30.42 
 
 		 371 aa  81.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  27.92 
 
 		 460 aa  81.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.02 
 
 		 985 aa  80.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  35.37 
 
 		 337 aa  80.1  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 828 aa  78.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 		 782 aa  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 1279 aa  77  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  30.94 
 
 		 332 aa  77  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 1186 aa  76.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 729 aa  75.9  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  31.74 
 
 		 325 aa  74.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 		 991 aa  74.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  26.13 
 
 		 903 aa  72  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  19.56 
 
 		 923 aa  72  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  28.78 
 
 		 445 aa  71.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 3145 aa  70.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1142 aa  69.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 		 767 aa  68.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>