146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4095 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 729 aa  1410    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  46.47 
 
 		 717 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 2741 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.06 
 
 		 2741 aa  180  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  38.11 
 
 		 916 aa  153  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 1162 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1162 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.56 
 
 		 828 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1054 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1060 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 854 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.15 
 
 		 968 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  33.22 
 
 		 903 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.27 
 
 		 809 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 868 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 923 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.83 
 
 		 991 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 868 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 1025 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  31.21 
 
 		 532 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 937 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  46.02 
 
 		 1475 aa  105  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.27 
 
 		 884 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1365 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.09 
 
 		 1009 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.31 
 
 		 854 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.75 
 
 		 950 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  29.75 
 
 		 950 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1215 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.72 
 
 		 3535 aa  99  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.72 
 
 		 3419 aa  99  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.96 
 
 		 3298 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.98 
 
 		 3537 aa  98.2  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.4 
 
 		 957 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1051 aa  95.1  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 851 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1409 aa  94.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 851 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 		 919 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 949 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  23.71 
 
 		 891 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1247 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  31.17 
 
 		 447 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  28.38 
 
 		 853 aa  91.3  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 905 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 822 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.64 
 
 		 1328 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  25.72 
 
 		 918 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 905 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1024 aa  88.2  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  28.11 
 
 		 553 aa  87.4  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.61 
 
 		 1772 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 1779 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.99 
 
 		 3299 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 796 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  30.42 
 
 		 893 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 885 aa  84.7  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1036 aa  84.7  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1039 aa  84.3  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 		 874 aa  83.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  35.53 
 
 		 827 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1051 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.3 
 
 		 1650 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.25 
 
 		 1007 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.82 
 
 		 960 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  26.49 
 
 		 845 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1247 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  23.32 
 
 		 909 aa  80.9  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  27.82 
 
 		 698 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 994 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  25.06 
 
 		 1219 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  22.65 
 
 		 944 aa  78.2  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1246 aa  77.4  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 928 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 880 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1025 aa  77  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1711 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  31.53 
 
 		 937 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  34.18 
 
 		 192 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  25.26 
 
 		 725 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 846 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  24.79 
 
 		 840 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  36.72 
 
 		 1507 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  26.86 
 
 		 989 aa  74.3  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  29.53 
 
 		 890 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  30.43 
 
 		 905 aa  74.3  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  32.05 
 
 		 643 aa  74.3  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 883 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 1276 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  30.71 
 
 		 811 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.42 
 
 		 2637 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  29.39 
 
 		 371 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  33.1 
 
 		 959 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  35.42 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  31.65 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1621 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1544 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  40.18 
 
 		 121 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  30.62 
 
 		 890 aa  68.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1055 aa  68.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>