196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0790 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
916 aa  1817    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.16 
 
 
2741 aa  224  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.59 
 
 
2741 aa  220  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 
1162 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 
1162 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.51 
 
 
991 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  37.69 
 
 
717 aa  155  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 
1060 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.16 
 
 
809 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
1247 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
729 aa  150  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
1779 aa  148  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  32.36 
 
 
532 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  35.81 
 
 
873 aa  145  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 
828 aa  144  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.84 
 
 
1009 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
1215 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 
1025 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.38 
 
 
968 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.97 
 
 
893 aa  129  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 
854 aa  125  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.82 
 
 
1266 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
1711 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.16 
 
 
1328 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.63 
 
 
884 aa  123  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  24.7 
 
 
1219 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  33.11 
 
 
903 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
1621 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
1544 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  37.69 
 
 
874 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 
1186 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.94 
 
 
1007 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
868 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 
902 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  25.72 
 
 
992 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  33.82 
 
 
848 aa  111  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  32.99 
 
 
853 aa  109  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 
897 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
994 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.3 
 
 
854 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
868 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  32.68 
 
 
811 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  30.79 
 
 
905 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 
957 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
851 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.69 
 
 
919 aa  104  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  30.29 
 
 
944 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
1054 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  30.89 
 
 
890 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  28.43 
 
 
595 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
937 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  30.03 
 
 
890 aa  101  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 
1409 aa  101  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
846 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  29.74 
 
 
447 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  40.49 
 
 
1036 aa  99.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
928 aa  97.8  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.24 
 
 
3537 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.78 
 
 
3535 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.78 
 
 
3419 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
811 aa  95.9  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
905 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  22.81 
 
 
909 aa  95.1  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 
949 aa  94.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.78 
 
 
3298 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.71 
 
 
1772 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.26 
 
 
3299 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  29.32 
 
 
883 aa  92  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.24 
 
 
1650 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  33.33 
 
 
1051 aa  91.3  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 
904 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
905 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
883 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  25.12 
 
 
1024 aa  89.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  25.58 
 
 
1259 aa  88.2  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  28.26 
 
 
950 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  27.74 
 
 
950 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  29.46 
 
 
751 aa  87  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
851 aa  87.4  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  26.08 
 
 
960 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  27.54 
 
 
845 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  37.58 
 
 
1025 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
1276 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
880 aa  86.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  34.74 
 
 
643 aa  85.9  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.15 
 
 
840 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
1365 aa  85.5  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.95 
 
 
827 aa  85.1  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  29.74 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
822 aa  84.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  23.19 
 
 
918 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  36.52 
 
 
1475 aa  84  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  25.59 
 
 
553 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  37.89 
 
 
1039 aa  82.8  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  29.23 
 
 
891 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
796 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
923 aa  80.9  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  27.68 
 
 
959 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  24.23 
 
 
418 aa  79  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  31.91 
 
 
1142 aa  78.2  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>