More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2763 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  63.07 
 
 		 1779 aa  1435    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  71.11 
 
 		 1321 aa  968    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1711 aa  3518    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  75.95 
 
 		 1083 aa  927    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  51.92 
 
 		 1448 aa  955    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  57.93 
 
 		 1247 aa  991    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  51.85 
 
 		 1621 aa  1248    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  58.71 
 
 		 1544 aa  1221    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  48.83 
 
 		 1219 aa  972    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  41.42 
 
 		 994 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.27 
 
 		 992 aa  388  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 1911 aa  323  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  45.31 
 
 		 552 aa  298  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  46.18 
 
 		 393 aa  281  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  35.16 
 
 		 1141 aa  277  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  39.82 
 
 		 724 aa  248  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  83.89 
 
 		 821 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  83.22 
 
 		 824 aa  246  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  83.22 
 
 		 823 aa  246  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  80.65 
 
 		 825 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  82.67 
 
 		 824 aa  246  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  81.88 
 
 		 846 aa  244  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  83.22 
 
 		 822 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  83.11 
 
 		 843 aa  244  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  83.22 
 
 		 822 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  83.11 
 
 		 825 aa  244  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  81.76 
 
 		 855 aa  243  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  81.76 
 
 		 855 aa  243  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  75.31 
 
 		 843 aa  243  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  74.7 
 
 		 841 aa  242  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  81.76 
 
 		 859 aa  241  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  80 
 
 		 859 aa  241  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  77.22 
 
 		 842 aa  239  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  78.43 
 
 		 842 aa  240  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  30.1 
 
 		 934 aa  239  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.36 
 
 		 1266 aa  236  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  32.15 
 
 		 982 aa  226  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  70.47 
 
 		 825 aa  209  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  40.34 
 
 		 599 aa  195  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  40.28 
 
 		 596 aa  194  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  76.19 
 
 		 840 aa  194  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  67.33 
 
 		 814 aa  192  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  60.48 
 
 		 815 aa  191  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.05 
 
 		 1007 aa  189  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 422 aa  186  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  59.86 
 
 		 834 aa  170  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  59.86 
 
 		 835 aa  170  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.51 
 
 		 1694 aa  170  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  59.86 
 
 		 830 aa  169  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  59.86 
 
 		 834 aa  169  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  59.15 
 
 		 846 aa  169  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  59.86 
 
 		 836 aa  169  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  59.86 
 
 		 834 aa  169  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  59.86 
 
 		 844 aa  169  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  59.86 
 
 		 844 aa  169  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  59.86 
 
 		 839 aa  169  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  59.86 
 
 		 836 aa  169  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  59.86 
 
 		 850 aa  169  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  59.86 
 
 		 848 aa  169  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  59.86 
 
 		 837 aa  169  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  59.86 
 
 		 841 aa  169  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  59.86 
 
 		 854 aa  169  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  59.15 
 
 		 855 aa  168  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  59.15 
 
 		 851 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  59.15 
 
 		 852 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  61.94 
 
 		 858 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  59.15 
 
 		 847 aa  167  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  59.15 
 
 		 847 aa  167  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  59.15 
 
 		 847 aa  167  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  59.15 
 
 		 852 aa  167  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  59.15 
 
 		 847 aa  167  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  59.15 
 
 		 847 aa  167  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  59.15 
 
 		 848 aa  167  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  59.15 
 
 		 851 aa  166  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  59.15 
 
 		 842 aa  166  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  61.94 
 
 		 840 aa  166  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  58.45 
 
 		 861 aa  166  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  59.15 
 
 		 858 aa  166  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  58.45 
 
 		 830 aa  164  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  58.45 
 
 		 830 aa  164  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  61.94 
 
 		 843 aa  162  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  57.04 
 
 		 851 aa  161  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  57.75 
 
 		 812 aa  160  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1276 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  54.14 
 
 		 814 aa  158  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  55.63 
 
 		 866 aa  158  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  57.75 
 
 		 810 aa  158  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  57.46 
 
 		 834 aa  158  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  55.63 
 
 		 869 aa  157  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  57.04 
 
 		 811 aa  157  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  57.89 
 
 		 820 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  57.89 
 
 		 811 aa  156  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  58.33 
 
 		 862 aa  156  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  57.89 
 
 		 811 aa  155  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  56.34 
 
 		 879 aa  155  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  53.52 
 
 		 812 aa  154  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.14 
 
 		 811 aa  154  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  57.14 
 
 		 811 aa  154  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  57.14 
 
 		 811 aa  154  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.14 
 
 		 811 aa  154  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>