189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4958 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  56.25 
 
 		 1779 aa  1358    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  68.36 
 
 		 1321 aa  1139    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  51.96 
 
 		 1711 aa  1087    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  67.32 
 
 		 1083 aa  849    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  38.13 
 
 		 1219 aa  728    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  51.46 
 
 		 1448 aa  1047    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  71.89 
 
 		 1247 aa  811    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1621 aa  3345    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  81.28 
 
 		 1544 aa  1956    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  35.35 
 
 		 1266 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  51.84 
 
 		 994 aa  479  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 		 1911 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  29.08 
 
 		 992 aa  342  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  46.19 
 
 		 393 aa  340  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  46.36 
 
 		 552 aa  338  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  33.18 
 
 		 1141 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  40.32 
 
 		 724 aa  269  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  30.12 
 
 		 982 aa  225  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.64 
 
 		 934 aa  218  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  40.46 
 
 		 596 aa  206  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  39.53 
 
 		 599 aa  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.18 
 
 		 1694 aa  192  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 422 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 878 aa  161  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 1869 aa  145  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  34.08 
 
 		 714 aa  145  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.32 
 
 		 810 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  22.19 
 
 		 962 aa  144  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1450 aa  139  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  36.86 
 
 		 1502 aa  135  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  35.92 
 
 		 476 aa  125  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  26.64 
 
 		 985 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  22.01 
 
 		 1007 aa  123  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  37.87 
 
 		 199 aa  123  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 1288 aa  122  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 916 aa  121  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  31.58 
 
 		 720 aa  120  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  29.3 
 
 		 737 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1060 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.23 
 
 		 1276 aa  102  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.38 
 
 		 733 aa  102  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 2741 aa  101  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 		 2741 aa  101  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.79 
 
 		 991 aa  99.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  35.89 
 
 		 720 aa  99.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  30.94 
 
 		 322 aa  95.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  30.94 
 
 		 322 aa  95.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  34.66 
 
 		 341 aa  94.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1276 aa  92.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 644 aa  91.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  21.72 
 
 		 957 aa  90.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 949 aa  89  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.66 
 
 		 1131 aa  88.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  31.46 
 
 		 326 aa  88.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  27.43 
 
 		 490 aa  88.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  30.5 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  35.84 
 
 		 325 aa  84.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 632 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  32.38 
 
 		 337 aa  81.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 454 aa  80.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  32.47 
 
 		 326 aa  78.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  32.47 
 
 		 326 aa  78.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.21 
 
 		 828 aa  77  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  29.09 
 
 		 327 aa  76.3  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  27.86 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.98 
 
 		 717 aa  74.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  26.67 
 
 		 827 aa  75.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  28.73 
 
 		 445 aa  73.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  29.83 
 
 		 332 aa  73.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1105 aa  73.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1192 aa  73.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  31.71 
 
 		 325 aa  73.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  34.07 
 
 		 501 aa  71.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 		 1022 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  21.97 
 
 		 809 aa  70.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  28.2 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  21.94 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 		 1279 aa  68.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.28 
 
 		 1040 aa  67.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 3145 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.72 
 
 		 884 aa  67.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  28.4 
 
 		 565 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  24.52 
 
 		 1507 aa  67  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  23.74 
 
 		 919 aa  67  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1238 aa  66.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  26.38 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1025 aa  65.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 412 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  22.91 
 
 		 1328 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 1186 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  24.2 
 
 		 836 aa  64.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1051 aa  64.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.16 
 
 		 968 aa  63.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.77 
 
 		 573 aa  63.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  27.34 
 
 		 532 aa  63.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 		 1737 aa  63.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 729 aa  63.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 718 aa  62.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 843 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>