48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1074 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  805    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  73.98 
 
 		 421 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  58.38 
 
 		 412 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  53.27 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  47.22 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  40.75 
 
 		 405 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  39.1 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  38.67 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  36.59 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  36.89 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  33.65 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  33.65 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  31.93 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  37.37 
 
 		 332 aa  96.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  38.58 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  38.58 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  38.25 
 
 		 327 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  35.29 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  32.51 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 994 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1621 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  34.33 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  30.73 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  32.17 
 
 		 1219 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  30.3 
 
 		 992 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1711 aa  63.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 1779 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  33.85 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  28.37 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  33.97 
 
 		 1141 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  26.57 
 
 		 720 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  35.53 
 
 		 724 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1911 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  32.47 
 
 		 599 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1448 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1083 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  32.69 
 
 		 737 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1544 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  31.65 
 
 		 560 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1321 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1247 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  21.67 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  27.04 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  30.52 
 
 		 982 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  26.64 
 
 		 720 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  24.72 
 
 		 962 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>