25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0968 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  837    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  77.19 
 
 
405 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  55.05 
 
 
425 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  40.56 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  37.28 
 
 
405 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  39.1 
 
 
416 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  37.97 
 
 
426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  29.27 
 
 
326 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  29.15 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  25.25 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  25.25 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  29.33 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  23.79 
 
 
325 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  31.51 
 
 
326 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  31.51 
 
 
326 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  26.36 
 
 
332 aa  59.7  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  28.75 
 
 
737 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  23.76 
 
 
327 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  24.16 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  30.83 
 
 
1141 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  24.12 
 
 
490 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  25 
 
 
720 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  30.37 
 
 
962 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  25.44 
 
 
934 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>