48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0474 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
405 aa  801    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  49.12 
 
 
425 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  44.42 
 
 
412 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  42 
 
 
416 aa  233  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  40.84 
 
 
421 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  38.35 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  42.89 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  37.78 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  36.14 
 
 
322 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  36.14 
 
 
322 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  35.92 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  37.87 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  38.76 
 
 
326 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  38.76 
 
 
326 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  33.49 
 
 
326 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  39.87 
 
 
337 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  32.42 
 
 
332 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  35.36 
 
 
325 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  30.17 
 
 
325 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  37.8 
 
 
724 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 
994 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  32.43 
 
 
1219 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  31.15 
 
 
552 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  35.8 
 
 
596 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  35.58 
 
 
714 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  30.69 
 
 
720 aa  63.5  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  38.27 
 
 
1141 aa  63.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  30.98 
 
 
737 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  34.11 
 
 
599 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1621 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
1911 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
1083 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
1448 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  31.79 
 
 
982 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  25.43 
 
 
501 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  30.51 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
1779 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
422 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  24.5 
 
 
934 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
1711 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  31.84 
 
 
560 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
1502 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  28.93 
 
 
992 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
1544 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.7 
 
 
1266 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  36.84 
 
 
720 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1247 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
1869 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>