55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0707 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  53.55 
 
 		 341 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  48.57 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  48.57 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  51.64 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  48.45 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  54.83 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  47.78 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  46.98 
 
 		 327 aa  279  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  36.49 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  42.31 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  38.81 
 
 		 416 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  36.11 
 
 		 426 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 994 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  31.22 
 
 		 425 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  35.29 
 
 		 714 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  38.4 
 
 		 1219 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  30.94 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1911 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 1621 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  32.52 
 
 		 934 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  36 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1448 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1083 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 1711 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 		 1502 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  30.85 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  32.03 
 
 		 1141 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  35.68 
 
 		 724 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 1779 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  30.77 
 
 		 992 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  35.03 
 
 		 599 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  30.1 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  28.34 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  33 
 
 		 982 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  28.31 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  32.45 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  38.84 
 
 		 1247 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 1544 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  30.48 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  33.57 
 
 		 596 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 1869 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  31.51 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1321 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  31.76 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  31.33 
 
 		 962 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  28.97 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3871  hypothetical protein  66.67 
 
 		 42 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  23.32 
 
 		 841 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  24.07 
 
 		 490 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>