155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6113 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  75.33 
 
 		 724 aa  885    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  86.26 
 
 		 599 aa  934    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1166    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  55.87 
 
 		 1141 aa  343  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  47.04 
 
 		 1219 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  46.87 
 
 		 994 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1621 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 1779 aa  177  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 1911 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  41.02 
 
 		 560 aa  171  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  41.78 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  39.13 
 
 		 714 aa  161  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 		 1448 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  37.54 
 
 		 1711 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  41.82 
 
 		 1083 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  44.96 
 
 		 1502 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  29.08 
 
 		 934 aa  147  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  38.67 
 
 		 476 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 1544 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  30.73 
 
 		 445 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  36.36 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.85 
 
 		 992 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 		 1321 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  39.14 
 
 		 1247 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  29.77 
 
 		 982 aa  120  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  43.56 
 
 		 422 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  34.65 
 
 		 720 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 644 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 632 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  32.77 
 
 		 737 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  43.61 
 
 		 1869 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1119 aa  104  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  25.85 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1054 aa  98.2  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  29.52 
 
 		 720 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.03 
 
 		 810 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 878 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  27.22 
 
 		 897 aa  94  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.06 
 
 		 1694 aa  88.6  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.78 
 
 		 732 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 909 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  23.72 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1253  hypothetical protein  32.43 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.238596  normal  0.0174069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 685 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.96 
 
 		 1611 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  32.27 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  21.26 
 
 		 962 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  34 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 817 aa  67.8  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  35.8 
 
 		 405 aa  67  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  30.26 
 
 		 327 aa  67  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.04 
 
 		 816 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  30.51 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  30.51 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 730 aa  65.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  32.72 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.64 
 
 		 725 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1864  hypothetical protein  32.8 
 
 		 682 aa  63.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.837746  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 718 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  27.63 
 
 		 932 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1123 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.09 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 1486 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  35.88 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.4 
 
 		 1022 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 1288 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.61 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  33.57 
 
 		 326 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  33.57 
 
 		 326 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 702 aa  57  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 639 aa  57  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.17 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 714 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  25.82 
 
 		 799 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.52 
 
 		 2145 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.16 
 
 		 1056 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  28.87 
 
 		 325 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.03 
 
 		 626 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  35.67 
 
 		 412 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 714 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 614 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.87 
 
 		 623 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.7 
 
 		 626 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 611 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.4 
 
 		 733 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 927 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 578 aa  54.3  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 635 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 635 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  34.23 
 
 		 426 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.62 
 
 		 603 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 637 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.69 
 
 		 626 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1238 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 636 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>