184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1712 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 817 aa  1664    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.81 
 
 		 730 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  54.6 
 
 		 567 aa  349  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 1082 aa  203  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 1087 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  23.1 
 
 		 1611 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1238 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.6 
 
 		 2145 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  20.87 
 
 		 732 aa  94.7  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1550 aa  91.7  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  19.29 
 
 		 782 aa  88.2  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1123 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 1366 aa  82  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  20.94 
 
 		 2059 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1212 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.04 
 
 		 991 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  25 
 
 		 599 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.26 
 
 		 828 aa  75.1  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 		 1180 aa  74.3  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 949 aa  73.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  27.78 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  20.64 
 
 		 1060 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  20.58 
 
 		 1266 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  25.23 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  19.8 
 
 		 985 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  24.5 
 
 		 1056 aa  64.3  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 649 aa  62.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  31.79 
 
 		 675 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  23.68 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.92 
 
 		 825 aa  61.6  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 		 1213 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.99 
 
 		 784 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 911 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.59 
 
 		 988 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  26.16 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.92 
 
 		 1044 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.58 
 
 		 818 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  28.7 
 
 		 830 aa  58.9  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 785 aa  59.3  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  22.89 
 
 		 807 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.62 
 
 		 1404 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  22.18 
 
 		 2413 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.13 
 
 		 2240 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  22.91 
 
 		 672 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  17.67 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  21.13 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.07 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 		 1363 aa  58.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  23.68 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  28.57 
 
 		 897 aa  58.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.89 
 
 		 1056 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  20.36 
 
 		 897 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 843 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  21.16 
 
 		 1314 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 361 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  27.27 
 
 		 340 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2620  Tetratricopeptide TPR_4  25.17 
 
 		 303 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.866097  normal  0.0216756 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.68 
 
 		 758 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 1297 aa  55.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1676 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.09 
 
 		 594 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 927 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 827 aa  54.3  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  20.55 
 
 		 1009 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 973 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  27.42 
 
 		 1509 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 714 aa  53.9  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.4 
 
 		 740 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  19.9 
 
 		 694 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  21.71 
 
 		 1040 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.84 
 
 		 1228 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.1 
 
 		 745 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  22.88 
 
 		 708 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 792 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 1911 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 612 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 		 412 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  21.32 
 
 		 1261 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  21.14 
 
 		 280 aa  52.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 614 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4338  hypothetical protein  25.57 
 
 		 711 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 626 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 626 aa  52.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 945 aa  52.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 		 852 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 1486 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1068 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 614 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 614 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 614 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 614 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1039 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 3035 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 279 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3214  hypothetical protein  21.13 
 
 		 691 aa  51.2  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>