32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3214 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3214  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1375    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1082 aa  94.7  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.32 
 
 		 1611 aa  88.6  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  27.87 
 
 		 1087 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.71 
 
 		 2145 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.73 
 
 		 825 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 		 1373 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1123 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1526 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.68 
 
 		 730 aa  54.3  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25 
 
 		 1550 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 		 817 aa  51.2  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2302  WD-40 repeat protein  33.6 
 
 		 1142 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.616134 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.47 
 
 		 836 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  25.61 
 
 		 1279 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  25.61 
 
 		 1279 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1404 aa  47.4  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.36 
 
 		 490 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.23 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.54 
 
 		 782 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  27.92 
 
 		 1914 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  22.02 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  20.3 
 
 		 732 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 646 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2390  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 600 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  33.77 
 
 		 1656 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  27.63 
 
 		 1048 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.78 
 
 		 1348 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 343 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 1186 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>