41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0160 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 897 aa  1843    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2638  hypothetical protein  35.27 
 
 		 681 aa  145  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  26.79 
 
 		 539 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1119 aa  87  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1674  hypothetical protein  30.77 
 
 		 754 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.31 
 
 		 732 aa  80.9  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  21.89 
 
 		 1611 aa  70.5  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08530  TIR-like domain-containing protein (DUF1863)  28.04 
 
 		 875 aa  69.7  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  20.74 
 
 		 1082 aa  64.7  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 1215 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3214  hypothetical protein  21.83 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  20.36 
 
 		 817 aa  57.8  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 		 767 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.59 
 
 		 730 aa  55.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  22.3 
 
 		 1328 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  20.07 
 
 		 1123 aa  55.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.94 
 
 		 919 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4246  WD-40 repeat-containing protein  30.61 
 
 		 958 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  19.02 
 
 		 2145 aa  53.5  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 578 aa  53.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.51 
 
 		 924 aa  52  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  19.37 
 
 		 1087 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 343 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 1519 aa  50.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1025 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  22.73 
 
 		 1102 aa  48.5  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  22.14 
 
 		 1507 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.86 
 
 		 1186 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 909 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  26.71 
 
 		 1124 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 649 aa  47  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.67 
 
 		 493 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.82 
 
 		 1063 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5411  protein of unknown function DUF323  31.03 
 
 		 719 aa  46.2  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 1080 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 843 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 221 aa  45.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5674  WD-40 repeat protein  29.53 
 
 		 973 aa  44.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  30.77 
 
 		 323 aa  44.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.11 
 
 		 991 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  19.31 
 
 		 1060 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>