80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2267 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1519 aa  3049    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  35.27 
 
 
1123 aa  138  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.08 
 
 
732 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  19.89 
 
 
1082 aa  86.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  20.33 
 
 
1611 aa  81.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 
568 aa  78.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
568 aa  78.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
1215 aa  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 
924 aa  75.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 
1186 aa  72.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 
767 aa  72.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.21 
 
 
672 aa  72.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1288 aa  71.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
843 aa  69.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  18.71 
 
 
1087 aa  69.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.51 
 
 
1328 aa  68.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 
454 aa  68.6  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.12 
 
 
493 aa  64.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
1105 aa  63.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  24.84 
 
 
338 aa  62.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.86 
 
 
2145 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
444 aa  60.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.05 
 
 
919 aa  59.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
284 aa  58.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.9 
 
 
1131 aa  58.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.27 
 
 
825 aa  58.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 
771 aa  58.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.72 
 
 
1424 aa  57.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1507 aa  57  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
714 aa  56.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.6 
 
 
725 aa  56.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
481 aa  56.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.36 
 
 
1279 aa  55.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
953 aa  55.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.11 
 
 
1040 aa  54.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  22.75 
 
 
212 aa  55.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.38 
 
 
795 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.71 
 
 
991 aa  54.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
828 aa  53.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  20.6 
 
 
1119 aa  53.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  28.76 
 
 
680 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 
354 aa  53.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
937 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  19.81 
 
 
878 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 
469 aa  52.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.6 
 
 
1009 aa  52  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.22 
 
 
885 aa  51.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 
837 aa  51.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  27.98 
 
 
1731 aa  51.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  29.31 
 
 
404 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 
787 aa  50.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.61 
 
 
436 aa  50.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.05 
 
 
1550 aa  50.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  32.85 
 
 
665 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.68 
 
 
810 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 
1290 aa  50.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.89 
 
 
2240 aa  49.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
897 aa  49.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.83 
 
 
730 aa  49.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 
565 aa  48.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 
991 aa  48.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
949 aa  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 
702 aa  47.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.76 
 
 
1266 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.56 
 
 
1238 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
751 aa  47.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  20.39 
 
 
567 aa  47.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
966 aa  47.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  22.42 
 
 
799 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  22.22 
 
 
1914 aa  47  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  21.32 
 
 
1262 aa  47  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
649 aa  46.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  22.89 
 
 
1039 aa  46.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.16 
 
 
740 aa  45.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
639 aa  45.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.24 
 
 
883 aa  45.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24.04 
 
 
2413 aa  45.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
1714 aa  45.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 
992 aa  45.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
343 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>