30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3348 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.23 
 
 		 490 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4973  GUN4-like  35 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0162  hypothetical protein  28.28 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  33.68 
 
 		 570 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2988  GUN4 domain protein  33.33 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  31.63 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.43 
 
 		 1357 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  29.55 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1722  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0710398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 		 1348 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  32.35 
 
 		 818 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.69 
 
 		 888 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  29.29 
 
 		 441 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  36.99 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  32.88 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  31.11 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  27.64 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  29.29 
 
 		 1656 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  27.54 
 
 		 969 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1363 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4987  GUN4 domain protein  28.1 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.691295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 897 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1526 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  35.48 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1723  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 494 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0178  GUN4-like  26.96 
 
 		 559 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000497221  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  29.89 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3998  hypothetical protein  32.58 
 
 		 478 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>