48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0162 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0162  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  76.92 
 
 
684 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1711  hypothetical protein  57.96 
 
 
210 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0769  hypothetical protein  50.64 
 
 
191 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0158  hypothetical protein  98.51 
 
 
67 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0132434  normal  0.0247662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  35.03 
 
 
670 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4987  GUN4 domain protein  37.8 
 
 
336 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.691295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0178  GUN4-like  35.58 
 
 
559 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000497221  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2618  GUN4-like  31.37 
 
 
623 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2988  GUN4 domain protein  29.13 
 
 
240 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  35.07 
 
 
888 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  29.13 
 
 
818 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4973  GUN4-like  41.67 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1722  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
505 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0710398  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2617  GUN4-like  29.67 
 
 
600 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000986346  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1723  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 
494 aa  79.7  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973997  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2743  GUN4 domain protein  30.71 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4617  GUN4 domain protein  28.05 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3945  GUN4-like  32.31 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0311749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.62 
 
 
887 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2959  GUN4 domain protein  32 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3159  GUN4 domain protein  32 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0730  GUN4 domain protein  31.11 
 
 
165 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384858  normal  0.0865709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0174  GUN4-like  31.09 
 
 
552 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2323  GUN4 domain protein  29.69 
 
 
378 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2272  GUN4 domain protein  29.69 
 
 
378 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0701  GUN4 domain protein  30.37 
 
 
165 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5443  GUN4 domain protein  27.23 
 
 
526 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4076  GUN4 domain protein  30.06 
 
 
194 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4115  GUN4 domain protein  30.06 
 
 
194 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.657757  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1623  GUN4-like  30.2 
 
 
562 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.484626  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1708  hypothetical protein  30.77 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1918  GUN4-like  28.7 
 
 
135 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505634  normal  0.0848104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  28.28 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  26.6 
 
 
1049 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1622  GUN4 domain protein  24.22 
 
 
170 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4959  GUN4 domain protein  26.11 
 
 
254 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 
809 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2558  GUN4 domain protein  27.07 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3548  GUN4 domain protein  27.07 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1214  GUN4 domain-containing protein  26.53 
 
 
237 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4714  GUN4 domain protein  22.63 
 
 
256 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.322945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4854  GUN4 domain protein  25.64 
 
 
202 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5109  GUN4 domain protein  25.11 
 
 
441 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3036  GUN4-like  25.29 
 
 
240 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082563 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  25.24 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4843  GUN4 domain protein  27.91 
 
 
191 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 
1007 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>