More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6784 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1526 aa  3045    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1238 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  32.1 
 
 		 1611 aa  302  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  31.69 
 
 		 1736 aa  252  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0314468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  34.03 
 
 		 941 aa  228  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 1313 aa  222  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  32.81 
 
 		 782 aa  212  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.98 
 
 		 1279 aa  208  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 1596 aa  194  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1285 aa  181  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.85 
 
 		 636 aa  179  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1714 aa  173  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  30.85 
 
 		 985 aa  164  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  31.44 
 
 		 1266 aa  164  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.4 
 
 		 1914 aa  159  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  25.54 
 
 		 1429 aa  156  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1261 aa  153  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 		 957 aa  151  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  37.72 
 
 		 490 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1060 aa  150  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 		 1424 aa  147  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 1101 aa  146  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.1 
 
 		 1328 aa  145  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1215 aa  144  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.94 
 
 		 2145 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 		 991 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 454 aa  137  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.75 
 
 		 1195 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 		 1295 aa  132  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 809 aa  126  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 649 aa  125  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.51 
 
 		 725 aa  125  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.96 
 
 		 828 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1298 aa  122  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1063 aa  121  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  19.95 
 
 		 1180 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 924 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  31.89 
 
 		 834 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.68 
 
 		 1009 aa  116  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 444 aa  116  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 852 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 767 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1450 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1550 aa  114  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1298 aa  112  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 568 aa  111  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 568 aa  111  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 872 aa  108  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  25.64 
 
 		 979 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32.5 
 
 		 1021 aa  104  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.56 
 
 		 971 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 639 aa  102  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 885 aa  102  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 1288 aa  101  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 771 aa  101  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  26.5 
 
 		 755 aa  101  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  34.3 
 
 		 680 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 1186 aa  100  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 843 aa  100  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  30.29 
 
 		 718 aa  99.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 911 aa  98.6  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1025 aa  98.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 284 aa  97.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 		 787 aa  97.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.91 
 
 		 672 aa  95.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 1429 aa  94  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.35 
 
 		 816 aa  94.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.25 
 
 		 945 aa  94  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.7 
 
 		 999 aa  93.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  30.04 
 
 		 991 aa  92.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 751 aa  92.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  26.85 
 
 		 1103 aa  91.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  30.66 
 
 		 967 aa  90.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  27.84 
 
 		 1092 aa  90.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 1105 aa  90.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 438 aa  89.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1020 aa  89.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3508  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 426 aa  89.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.86 
 
 		 1040 aa  89  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  28.9 
 
 		 827 aa  88.6  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  26.54 
 
 		 1106 aa  88.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 910 aa  87.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 750 aa  86.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  28.77 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  28.24 
 
 		 1125 aa  86.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.89 
 
 		 1131 aa  86.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.71 
 
 		 1441 aa  86.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 343 aa  86.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  26.62 
 
 		 689 aa  85.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.74 
 
 		 732 aa  85.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 850 aa  85.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  24.56 
 
 		 1147 aa  85.1  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 909 aa  85.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 408 aa  84.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 362 aa  83.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  22.94 
 
 		 1507 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 		 667 aa  83.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 1064 aa  82.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  27.11 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>