63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4630 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  100 
 
 		 291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5224  hypothetical protein  55.17 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  56.78 
 
 		 374 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  36.21 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  35.09 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  34.53 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  31.88 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 1526 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  36.23 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.58 
 
 		 1656 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  42.55 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  28.21 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  36.67 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  32.14 
 
 		 1048 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  33.68 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.67 
 
 		 1348 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.25 
 
 		 1363 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  33.04 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.04 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  36.17 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  27.78 
 
 		 797 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  37.11 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  31.62 
 
 		 598 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  37.11 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  36.26 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  30.61 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  36.56 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2218  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 842 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.000600865  normal  0.100568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  28.97 
 
 		 441 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  31.43 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  29.2 
 
 		 1373 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  29.84 
 
 		 441 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 406 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 406 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  29.71 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0080  putative ATP/GTP binding protein  30.11 
 
 		 131 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  35.45 
 
 		 541 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.37 
 
 		 1016 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.37 
 
 		 1016 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  29.09 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  33.78 
 
 		 1611 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.16 
 
 		 825 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  30.85 
 
 		 947 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.03 
 
 		 1901 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  31.45 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  26.71 
 
 		 163 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  28.71 
 
 		 585 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  25 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0912  hypothetical protein  28.71 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251322  hitchhiker  0.0061785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  32.88 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  26 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 785 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  25.93 
 
 		 586 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5111  hypothetical protein  30.38 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  28.97 
 
 		 500 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4363  hypothetical protein  36.9 
 
 		 183 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104876  normal  0.566874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  22.4 
 
 		 157 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.57 
 
 		 880 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.57 
 
 		 880 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3017  hypothetical protein  22.47 
 
 		 323 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000253607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>