48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3474 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  100 
 
 		 311 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  38.85 
 
 		 314 aa  228  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  36.36 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  41.8 
 
 		 1611 aa  82.8  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  31.87 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  38.89 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 1526 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  29.17 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  33.09 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  34.26 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  30.72 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  31.21 
 
 		 797 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  28.31 
 
 		 549 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  30.58 
 
 		 598 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  35.16 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  37.23 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  28.85 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  38.89 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  26.26 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  25.61 
 
 		 489 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  27.52 
 
 		 775 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  31.06 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  24.1 
 
 		 482 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  29.24 
 
 		 544 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  30.7 
 
 		 384 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  30.7 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  31.87 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  31.87 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  36 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 570 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  22.9 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  23.81 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.89 
 
 		 1901 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.48 
 
 		 517 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  30.99 
 
 		 324 aa  45.8  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  27.69 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  22.9 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  27.52 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 		 1348 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1363 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  28 
 
 		 851 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  28.7 
 
 		 453 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  25.18 
 
 		 859 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.34 
 
 		 586 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.67 
 
 		 398 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  31.18 
 
 		 541 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>