40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1472 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  51.89 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  52.94 
 
 		 275 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  51.91 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  48.92 
 
 		 541 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  50 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2265  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.310683  normal  0.0284056 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4885  hypothetical protein  60 
 
 		 205 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  35.61 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  29.36 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  35.06 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  32.31 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  31.65 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  32.68 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  32.59 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  32.82 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  32.09 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1526 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1465  hypothetical protein  34.74 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.904043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2592  hypothetical protein  35.23 
 
 		 436 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1366  hypothetical protein  32.63 
 
 		 103 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  32.71 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  31.3 
 
 		 413 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  36.26 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  37.11 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  38.95 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  33.71 
 
 		 1373 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  31.11 
 
 		 1611 aa  45.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1298  ankyrin  27.59 
 
 		 797 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.94 
 
 		 1348 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.93 
 
 		 1363 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3186  hypothetical protein  39.39 
 
 		 644 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  31.87 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3194  hypothetical protein  27.66 
 
 		 100 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40710  hypothetical protein  32.26 
 
 		 120 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3452  hypothetical protein  32.26 
 
 		 100 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242056  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  23.91 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>