59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0746 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  100 
 
 		 598 aa  1203    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  82.1 
 
 		 796 aa  359  7e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2653  TIR protein  34.56 
 
 		 354 aa  108  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  41.07 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  26.65 
 
 		 1048 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  35.43 
 
 		 384 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  35.14 
 
 		 272 aa  87.8  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  33.07 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.89 
 
 		 1348 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.49 
 
 		 1656 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.48 
 
 		 1363 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  29.92 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  33.64 
 
 		 138 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  33.58 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.62 
 
 		 1357 aa  63.9  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  36.47 
 
 		 947 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  32.58 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.08 
 
 		 880 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.08 
 
 		 880 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.79 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  26.83 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  32.41 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1016 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1016 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  31.39 
 
 		 291 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  33.72 
 
 		 825 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  25.68 
 
 		 398 aa  54.3  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  38.27 
 
 		 250 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.78 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  34.06 
 
 		 544 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  28.07 
 
 		 331 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  30.58 
 
 		 311 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  24.37 
 
 		 398 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  32.69 
 
 		 137 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  29.13 
 
 		 851 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 		 1373 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.81 
 
 		 406 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.81 
 
 		 406 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  33.04 
 
 		 584 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 357 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  32.22 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  35.29 
 
 		 431 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  28.57 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  30.36 
 
 		 303 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  28.67 
 
 		 320 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  29.03 
 
 		 163 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 358 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  25.21 
 
 		 942 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  26.42 
 
 		 286 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  30.53 
 
 		 290 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  22.88 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  32.14 
 
 		 586 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.14 
 
 		 517 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  27.04 
 
 		 320 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  29.79 
 
 		 1279 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5111  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  29 
 
 		 1279 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  25.57 
 
 		 969 aa  43.9  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>