33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2742 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  100 
 
 		 320 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  57.14 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  47.48 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  47.56 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  43.08 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  52.94 
 
 		 584 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  43.45 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  44.1 
 
 		 942 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  48.39 
 
 		 135 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  37.5 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  37.84 
 
 		 851 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  31.48 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  35.33 
 
 		 364 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  35.88 
 
 		 183 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  85.9  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  27.59 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  28.65 
 
 		 585 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  31.29 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  29.58 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  28.87 
 
 		 552 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  34.34 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  25.77 
 
 		 1266 aa  57.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  30.84 
 
 		 1048 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.56 
 
 		 1348 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  32.43 
 
 		 570 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  30.26 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  30.39 
 
 		 947 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  32.65 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.7 
 
 		 1363 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  23.81 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.41 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  27.78 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>