39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3804 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  100 
 
 		 374 aa  769    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  56.78 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  39.02 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  37.21 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  34.62 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 1526 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  38.89 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  38.66 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  32.28 
 
 		 138 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  33.58 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  27.46 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  34.82 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  33.68 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.68 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  32.41 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  38 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  40 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  27.69 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  28.21 
 
 		 797 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  38.95 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  38.95 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.61 
 
 		 1348 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  30.51 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  29.13 
 
 		 1611 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  35 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  29.77 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1656 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  30.71 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  26.53 
 
 		 1048 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 		 1363 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0080  putative ATP/GTP binding protein  28.12 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  32.5 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  26.56 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.91 
 
 		 825 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2218  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 842 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.000600865  normal  0.100568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>