31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1920 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  100 
 
 		 250 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  72.26 
 
 		 245 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  41.63 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  41.18 
 
 		 320 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  41.5 
 
 		 584 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  37.58 
 
 		 942 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  40.74 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  36.91 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  37.76 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  34.16 
 
 		 327 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  38.81 
 
 		 135 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  35.5 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  37.67 
 
 		 383 aa  95.1  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  37.16 
 
 		 364 aa  92  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  31.29 
 
 		 851 aa  82  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  25.87 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  38.24 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  31.63 
 
 		 585 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  31.82 
 
 		 552 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  30 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  38.27 
 
 		 598 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  29.09 
 
 		 342 aa  52.4  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  31.01 
 
 		 796 aa  52.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.43 
 
 		 1348 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  30.99 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.47 
 
 		 1363 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  29.35 
 
 		 1048 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.36 
 
 		 1656 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.51 
 
 		 490 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  25.16 
 
 		 286 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.84 
 
 		 1373 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>