21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5590 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  854    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  28.21 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  31.78 
 
 		 303 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  29.7 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0912  hypothetical protein  28.18 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251322  hitchhiker  0.0061785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  34.78 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  25.26 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28 
 
 		 1656 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3083  TIR protein  33.78 
 
 		 824 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  35.29 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  31.17 
 
 		 137 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  29.17 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.03 
 
 		 880 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.71 
 
 		 1611 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.03 
 
 		 880 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  25.32 
 
 		 1048 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  27.4 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.64 
 
 		 1348 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  32.5 
 
 		 374 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.08 
 
 		 490 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>