More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5120 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  100 
 
 		 490 aa  992    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.43 
 
 		 919 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.68 
 
 		 1217 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  40 
 
 		 675 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.85 
 
 		 1163 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.75 
 
 		 1481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  35.05 
 
 		 1510 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 		 1363 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.22 
 
 		 1557 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  32.09 
 
 		 1364 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  30.69 
 
 		 947 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.25 
 
 		 1357 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  36.99 
 
 		 742 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.93 
 
 		 924 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.56 
 
 		 1240 aa  120  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 		 1878 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 1221 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  35.15 
 
 		 540 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  33.11 
 
 		 696 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1211 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 		 1760 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.11 
 
 		 740 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1399 aa  113  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1789 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  33.47 
 
 		 790 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  34.35 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.4 
 
 		 1652 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  30.79 
 
 		 316 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.08 
 
 		 630 aa  109  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 737 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.39 
 
 		 1247 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1229 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.63 
 
 		 1901 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.96 
 
 		 1523 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 		 1311 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.07 
 
 		 676 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.14 
 
 		 1236 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1552 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.18 
 
 		 1656 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1477 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  33.9 
 
 		 344 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1661 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.03 
 
 		 642 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  29.64 
 
 		 335 aa  106  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1599 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1807 aa  103  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.9 
 
 		 1443 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.9 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.56 
 
 		 1330 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  29.55 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 		 1193 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.53 
 
 		 1196 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  29.43 
 
 		 316 aa  101  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  31.1 
 
 		 872 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  32.32 
 
 		 1344 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.72 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 		 1711 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.67 
 
 		 1262 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.43 
 
 		 664 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.67 
 
 		 657 aa  97.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1190 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  29.9 
 
 		 335 aa  97.1  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 346 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  28.71 
 
 		 316 aa  97.1  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 		 577 aa  96.7  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.75 
 
 		 1161 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.4 
 
 		 677 aa  96.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.21 
 
 		 1626 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.54 
 
 		 576 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  30.07 
 
 		 1454 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.75 
 
 		 1161 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.87 
 
 		 1072 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.15 
 
 		 1242 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1474 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  33.82 
 
 		 1214 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  30.84 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.87 
 
 		 1072 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.24 
 
 		 865 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.41 
 
 		 930 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 		 1213 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1209 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 		 1188 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 1334 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1367 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  37.23 
 
 		 323 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25.46 
 
 		 1373 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  29.81 
 
 		 564 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.07 
 
 		 1190 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.87 
 
 		 682 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  32.07 
 
 		 652 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1714 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 		 1411 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.35 
 
 		 464 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1858 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  29.58 
 
 		 1183 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.94 
 
 		 443 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.47 
 
 		 1598 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1304 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>