More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0373 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  100 
 
 
316 aa  646    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  79.43 
 
 
316 aa  522  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  78.73 
 
 
316 aa  520  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  76.9 
 
 
316 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  71.75 
 
 
335 aa  482  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  71.11 
 
 
316 aa  471  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  69.72 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  42.95 
 
 
1163 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43 
 
 
696 aa  248  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  42.14 
 
 
1364 aa  247  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  40.83 
 
 
947 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  42.41 
 
 
1363 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.81 
 
 
1652 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  42.46 
 
 
1236 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  40.75 
 
 
1523 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  38.1 
 
 
1193 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.24 
 
 
1221 aa  225  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  42.81 
 
 
742 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.36 
 
 
630 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  37.76 
 
 
1188 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  39.45 
 
 
1454 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  40.78 
 
 
1553 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  40.78 
 
 
1510 aa  215  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  34.95 
 
 
1188 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  36.15 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.72 
 
 
1557 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  36.82 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  35.19 
 
 
1247 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.73 
 
 
1481 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.74 
 
 
676 aa  208  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  36.67 
 
 
434 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.46 
 
 
682 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  35.12 
 
 
1552 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.68 
 
 
677 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.27 
 
 
1686 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.53 
 
 
930 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  39.24 
 
 
1789 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.71 
 
 
740 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  36.65 
 
 
1416 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  38.95 
 
 
1878 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  39.87 
 
 
1357 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 
1443 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.99 
 
 
1711 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  37.63 
 
 
1868 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  33.78 
 
 
1474 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.74 
 
 
1609 aa  195  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.18 
 
 
664 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  37.87 
 
 
1190 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  36.81 
 
 
1599 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.17 
 
 
1760 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  34.49 
 
 
464 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  35.53 
 
 
778 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.99 
 
 
1262 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  33.55 
 
 
657 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  33.1 
 
 
1831 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.95 
 
 
1240 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.77 
 
 
1196 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.52 
 
 
919 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  37.19 
 
 
577 aa  185  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.49 
 
 
1348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  42.36 
 
 
1656 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.49 
 
 
1267 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.72 
 
 
1367 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  35.17 
 
 
1280 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  34.66 
 
 
1213 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  35.57 
 
 
1411 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.74 
 
 
675 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.45 
 
 
596 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
687 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  37.72 
 
 
1229 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  35.86 
 
 
1714 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.53 
 
 
1164 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.91 
 
 
1623 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  33.44 
 
 
1477 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.54 
 
 
1039 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  33.84 
 
 
443 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.24 
 
 
1217 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32.44 
 
 
1161 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.67 
 
 
1599 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  36.08 
 
 
1041 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  32.44 
 
 
1161 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  34.35 
 
 
872 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  30.88 
 
 
1661 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.19 
 
 
1598 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  36.39 
 
 
1211 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.04 
 
 
1547 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  31.42 
 
 
1901 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  41.04 
 
 
790 aa  170  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.72 
 
 
1807 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.45 
 
 
1583 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1607 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.03 
 
 
1626 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.04 
 
 
1856 aa  168  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.72 
 
 
1004 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  34.11 
 
 
1858 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  31.21 
 
 
774 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.06 
 
 
608 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  31.47 
 
 
565 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.21 
 
 
576 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.73 
 
 
1208 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>