More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2167 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 316 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  82.91 
 
 		 316 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  79.43 
 
 		 316 aa  522  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  77 
 
 		 316 aa  502  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  75.24 
 
 		 316 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  72.7 
 
 		 335 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  70.03 
 
 		 317 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.52 
 
 		 1652 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  42.41 
 
 		 1363 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43.2 
 
 		 696 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  40.14 
 
 		 947 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  42.36 
 
 		 1364 aa  244  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40 
 
 		 1193 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  43.9 
 
 		 1163 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  38.6 
 
 		 1236 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  37.67 
 
 		 1523 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 1221 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  43.53 
 
 		 742 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  38.31 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  39.1 
 
 		 1454 aa  215  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  37.54 
 
 		 344 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.91 
 
 		 1686 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.37 
 
 		 676 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.05 
 
 		 630 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  41.55 
 
 		 1357 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  39.79 
 
 		 1878 aa  207  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.49 
 
 		 1557 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  37.41 
 
 		 1188 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  38.19 
 
 		 1789 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.07 
 
 		 740 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  39.19 
 
 		 1196 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.49 
 
 		 930 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  37.94 
 
 		 1510 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.51 
 
 		 1481 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  38.33 
 
 		 1553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  35.64 
 
 		 657 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  37.98 
 
 		 1443 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  40.34 
 
 		 919 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.08 
 
 		 1240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.57 
 
 		 677 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  35.13 
 
 		 1247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  36.46 
 
 		 1599 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  32.29 
 
 		 1188 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.75 
 
 		 1711 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  36.07 
 
 		 1474 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.97 
 
 		 682 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.79 
 
 		 1760 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.39 
 
 		 664 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  34.72 
 
 		 1213 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  40.73 
 
 		 577 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  33.1 
 
 		 1831 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  38.31 
 
 		 434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  36.75 
 
 		 1416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.29 
 
 		 1552 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  33.68 
 
 		 464 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  38.78 
 
 		 1211 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  33 
 
 		 1262 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  35.86 
 
 		 778 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.44 
 
 		 1217 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  37.37 
 
 		 1190 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  35.45 
 
 		 1411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  39.93 
 
 		 675 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  35.13 
 
 		 1661 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.8 
 
 		 1868 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  34.45 
 
 		 1714 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  34.14 
 
 		 1367 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  35.64 
 
 		 1807 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  34.98 
 
 		 443 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  35.74 
 
 		 1280 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.7 
 
 		 737 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.45 
 
 		 1609 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 		 687 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  34.42 
 
 		 1901 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.56 
 
 		 1267 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.8 
 
 		 1623 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  41.71 
 
 		 790 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.46 
 
 		 1004 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  35.89 
 
 		 1041 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  32.19 
 
 		 565 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  33.57 
 
 		 1161 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  32.88 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  33.57 
 
 		 1161 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  36.04 
 
 		 1229 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  33.55 
 
 		 872 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.58 
 
 		 1164 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.75 
 
 		 1598 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  32.67 
 
 		 774 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.97 
 
 		 1583 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  39.66 
 
 		 540 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.01 
 
 		 1348 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.61 
 
 		 716 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.49 
 
 		 642 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  40.28 
 
 		 1656 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.18 
 
 		 1823 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.76 
 
 		 924 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.51 
 
 		 576 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  34.11 
 
 		 1858 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.35 
 
 		 1208 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  38.59 
 
 		 335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1209 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>