More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2673 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
335 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  52.5 
 
 
696 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  46.34 
 
 
1364 aa  245  8e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  46.48 
 
 
1163 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.14 
 
 
1652 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  41.86 
 
 
1363 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  46.83 
 
 
1523 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  48.26 
 
 
344 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  47.89 
 
 
1454 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  47.57 
 
 
344 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  43.09 
 
 
1221 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  42.96 
 
 
947 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.46 
 
 
676 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.61 
 
 
677 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  43.38 
 
 
1789 aa  222  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  42.91 
 
 
434 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  39.64 
 
 
1236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  51.03 
 
 
1357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  50.82 
 
 
742 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.52 
 
 
1686 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  40.67 
 
 
1196 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  46.22 
 
 
919 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  40.59 
 
 
1831 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.23 
 
 
576 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.82 
 
 
1481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  43.82 
 
 
1510 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  41.7 
 
 
1193 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  48.5 
 
 
675 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  44.17 
 
 
1553 aa  209  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.16 
 
 
1760 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  40.41 
 
 
1188 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  37.76 
 
 
1474 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  40.48 
 
 
443 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.01 
 
 
1557 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  40.28 
 
 
1858 aa  205  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  42.32 
 
 
1878 aa  205  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  36.68 
 
 
657 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.95 
 
 
740 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  38.26 
 
 
1247 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  45.77 
 
 
1656 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  43.05 
 
 
1807 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.01 
 
 
642 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  42.81 
 
 
1190 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  53.75 
 
 
540 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  39.51 
 
 
1552 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.08 
 
 
630 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  43.75 
 
 
1217 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  42.36 
 
 
1599 aa  196  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  38.41 
 
 
774 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.69 
 
 
692 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.6 
 
 
930 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.16 
 
 
682 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  40.21 
 
 
778 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  42.19 
 
 
1714 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  44.3 
 
 
790 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  41.7 
 
 
1443 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.24 
 
 
1711 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  35.79 
 
 
1188 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  35.56 
 
 
589 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  44.06 
 
 
1901 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  38.83 
 
 
577 aa  188  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.53 
 
 
1208 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
1240 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  34.74 
 
 
464 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  37.39 
 
 
1661 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.33 
 
 
664 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.09 
 
 
596 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  38.11 
 
 
1213 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.84 
 
 
792 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.62 
 
 
1262 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 
687 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  50.48 
 
 
1214 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  34.3 
 
 
317 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.3 
 
 
737 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  39.05 
 
 
1041 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  43.97 
 
 
780 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.73 
 
 
1599 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.91 
 
 
1267 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  32.14 
 
 
578 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.27 
 
 
1039 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  45.14 
 
 
924 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  38.46 
 
 
1229 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.11 
 
 
1004 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  37.89 
 
 
1242 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  40.69 
 
 
565 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  36.01 
 
 
316 aa  175  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  36.49 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  37.5 
 
 
1367 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  32.98 
 
 
505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  39.68 
 
 
1411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  41.56 
 
 
652 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  42.91 
 
 
872 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.84 
 
 
1348 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  38.76 
 
 
1211 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  39.83 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  39.75 
 
 
1161 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  36.11 
 
 
564 aa  170  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  39.75 
 
 
1161 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  39.93 
 
 
608 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  35.21 
 
 
316 aa  170  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>