More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3023 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.51 
 
 
1599 aa  908    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  57.36 
 
 
1190 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  58.97 
 
 
1598 aa  1054    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  51.75 
 
 
1607 aa  1234    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  55.87 
 
 
1547 aa  988    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  56.06 
 
 
1583 aa  975    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  51.08 
 
 
1609 aa  1161    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  58.67 
 
 
1398 aa  887    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  58.88 
 
 
1626 aa  979    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.17 
 
 
1623 aa  785    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.49 
 
 
1684 aa  720    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.45 
 
 
1617 aa  844    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  100 
 
 
1267 aa  2516    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  47.18 
 
 
1013 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
969 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
969 aa  459  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  41.56 
 
 
897 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  31.81 
 
 
1553 aa  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.82 
 
 
1240 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.98 
 
 
1236 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.42 
 
 
1711 aa  423  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.27 
 
 
1481 aa  419  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.13 
 
 
1557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  30.67 
 
 
1510 aa  399  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.68 
 
 
1686 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.92 
 
 
1823 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.7 
 
 
1760 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  47.95 
 
 
1032 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.41 
 
 
1357 aa  365  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
972 aa  359  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  37.34 
 
 
1652 aa  356  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.56 
 
 
1363 aa  355  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.81 
 
 
1163 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  41.56 
 
 
1367 aa  347  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 
1078 aa  346  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  41.81 
 
 
1552 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  50.7 
 
 
973 aa  338  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  45.78 
 
 
1523 aa  332  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  50.58 
 
 
947 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  36.58 
 
 
1656 aa  327  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  37.33 
 
 
1229 aa  325  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  31.53 
 
 
1491 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43.05 
 
 
696 aa  322  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  54.27 
 
 
1046 aa  321  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  40.97 
 
 
1789 aa  315  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  37.03 
 
 
1364 aa  311  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  30.08 
 
 
1661 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  44.1 
 
 
1454 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.25 
 
 
1714 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.35 
 
 
1344 aa  306  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.69 
 
 
1221 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  35.28 
 
 
1196 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  46.89 
 
 
965 aa  304  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
1085 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  35.76 
 
 
1193 aa  292  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.92 
 
 
1217 aa  291  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  33.7 
 
 
947 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 
1334 aa  291  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  42.27 
 
 
1211 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  37.53 
 
 
1416 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  38.52 
 
 
1100 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.21 
 
 
1072 aa  286  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.52 
 
 
1868 aa  285  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.77 
 
 
1072 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.02 
 
 
1076 aa  282  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.54 
 
 
1262 aa  279  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  35.18 
 
 
1474 aa  278  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.3 
 
 
930 aa  277  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.64 
 
 
1190 aa  277  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.31 
 
 
1348 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  35.39 
 
 
1188 aa  275  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  57.2 
 
 
425 aa  270  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  41.54 
 
 
919 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  38.27 
 
 
1766 aa  268  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  32.41 
 
 
1247 aa  268  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  32.59 
 
 
728 aa  263  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35.86 
 
 
1858 aa  263  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.12 
 
 
1161 aa  261  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.12 
 
 
1161 aa  260  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  30.51 
 
 
1831 aa  259  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  32.02 
 
 
1213 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  33.66 
 
 
1176 aa  252  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  38.5 
 
 
1014 aa  251  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  37.39 
 
 
1020 aa  250  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 
1005 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  31.18 
 
 
505 aa  247  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38.86 
 
 
1599 aa  244  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  40.21 
 
 
1878 aa  244  7.999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 
1443 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  30.47 
 
 
1177 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  27.43 
 
 
1657 aa  237  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.07 
 
 
740 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  43.77 
 
 
698 aa  235  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.41 
 
 
1399 aa  235  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.59 
 
 
1373 aa  234  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  27.69 
 
 
1183 aa  231  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  28.01 
 
 
1164 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 
1807 aa  228  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.41 
 
 
1901 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.14 
 
 
1016 aa  224  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>