More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5605 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  100 
 
 
1823 aa  3639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33 
 
 
1598 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.88 
 
 
1583 aa  530  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.28 
 
 
1684 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.5 
 
 
1623 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.63 
 
 
1617 aa  482  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.62 
 
 
1686 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.61 
 
 
1547 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.18 
 
 
1626 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.81 
 
 
1599 aa  443  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 
1553 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 
1236 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.93 
 
 
1711 aa  416  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.6 
 
 
1481 aa  403  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.02 
 
 
1510 aa  396  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.5 
 
 
1398 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.28 
 
 
1760 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  29.68 
 
 
1357 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.38 
 
 
1344 aa  353  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.35 
 
 
1831 aa  346  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.98 
 
 
1652 aa  328  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
1078 aa  328  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.15 
 
 
1190 aa  327  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.78 
 
 
1229 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  31.69 
 
 
1789 aa  316  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.39 
 
 
1364 aa  315  4.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.05 
 
 
1240 aa  310  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.58 
 
 
1454 aa  309  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.3 
 
 
1523 aa  309  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 
973 aa  308  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  39.87 
 
 
972 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.6 
 
 
1363 aa  303  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  40.5 
 
 
969 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  40.5 
 
 
969 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 
897 aa  302  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
965 aa  301  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.07 
 
 
1334 aa  300  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.85 
 
 
1367 aa  290  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.34 
 
 
1163 aa  289  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.79 
 
 
1217 aa  288  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  30.69 
 
 
1221 aa  283  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.22 
 
 
1491 aa  283  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.66 
 
 
1196 aa  282  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  31.5 
 
 
1552 aa  280  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.29 
 
 
1190 aa  280  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.6 
 
 
1443 aa  279  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  34.2 
 
 
696 aa  279  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.84 
 
 
1474 aa  278  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.84 
 
 
1557 aa  278  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 
1661 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.05 
 
 
1188 aa  276  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.6 
 
 
1193 aa  275  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.12 
 
 
947 aa  274  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.99 
 
 
1161 aa  273  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  31.2 
 
 
1161 aa  272  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
1032 aa  271  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  39.07 
 
 
1046 aa  270  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.73 
 
 
1607 aa  268  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30 
 
 
1262 aa  267  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.42 
 
 
1807 aa  267  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.2 
 
 
1213 aa  262  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.05 
 
 
1656 aa  257  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  39.74 
 
 
1013 aa  257  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.5 
 
 
1868 aa  257  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.56 
 
 
1399 aa  256  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.76 
 
 
1609 aa  256  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  37.66 
 
 
1085 aa  255  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.66 
 
 
919 aa  255  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30 
 
 
1901 aa  255  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  28.31 
 
 
1699 aa  248  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 
1005 aa  247  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.77 
 
 
1265 aa  243  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
1014 aa  242  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.78 
 
 
1208 aa  237  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.53 
 
 
1190 aa  236  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.64 
 
 
1304 aa  235  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  25.93 
 
 
1657 aa  233  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 
1020 aa  233  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.42 
 
 
1714 aa  233  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  28.64 
 
 
1733 aa  233  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.49 
 
 
1247 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.52 
 
 
1214 aa  229  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  30.2 
 
 
1176 aa  229  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
947 aa  228  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.4 
 
 
1211 aa  227  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 
1164 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.22 
 
 
1348 aa  224  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.94 
 
 
930 aa  224  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26.43 
 
 
1177 aa  224  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  32.03 
 
 
1766 aa  223  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  28.42 
 
 
1308 aa  223  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  29.86 
 
 
901 aa  219  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.17 
 
 
924 aa  219  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.68 
 
 
1188 aa  218  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.18 
 
 
1416 aa  218  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.99 
 
 
1183 aa  215  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.46 
 
 
1267 aa  214  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 
1279 aa  213  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.61 
 
 
1856 aa  209  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  25.57 
 
 
1279 aa  210  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>