More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6600 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  52.03 
 
 		 1699 aa  1496    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1733 aa  3348    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31.98 
 
 		 1334 aa  400  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  32.95 
 
 		 1344 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.44 
 
 		 1686 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  32.15 
 
 		 1265 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1553 aa  361  7e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.83 
 
 		 1711 aa  357  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 		 1481 aa  350  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.67 
 
 		 1357 aa  346  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.37 
 
 		 1240 aa  326  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.74 
 
 		 1236 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  36.4 
 
 		 901 aa  300  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1657 aa  298  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1510 aa  295  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.08 
 
 		 1760 aa  266  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1230 aa  266  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  35.36 
 
 		 885 aa  265  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.97 
 
 		 1583 aa  247  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.32 
 
 		 1599 aa  244  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.75 
 
 		 1607 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.17 
 
 		 1623 aa  236  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.97 
 
 		 1617 aa  234  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.79 
 
 		 1823 aa  226  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.05 
 
 		 1598 aa  223  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.8 
 
 		 919 aa  223  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.76 
 
 		 1609 aa  219  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.87 
 
 		 1217 aa  218  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  34.58 
 
 		 1152 aa  215  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  34.22 
 
 		 1157 aa  214  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1229 aa  212  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 1363 aa  210  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  30.21 
 
 		 1308 aa  206  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.71 
 
 		 1626 aa  206  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1211 aa  199  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  40.95 
 
 		 940 aa  199  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.55 
 
 		 1355 aa  198  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1073 aa  199  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.93 
 
 		 1194 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.52 
 
 		 924 aa  197  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.47 
 
 		 947 aa  191  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  29.71 
 
 		 902 aa  191  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.45 
 
 		 1190 aa  190  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  44.8 
 
 		 1000 aa  186  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  33.82 
 
 		 696 aa  186  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1491 aa  184  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 		 972 aa  181  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  44 
 
 		 654 aa  180  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 1022 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.8 
 
 		 1652 aa  178  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.67 
 
 		 1267 aa  178  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1196 aa  178  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.82 
 
 		 1398 aa  177  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  43.18 
 
 		 919 aa  176  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 1093 aa  176  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  31.05 
 
 		 1301 aa  176  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  44.19 
 
 		 378 aa  176  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  43.08 
 
 		 833 aa  175  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 1078 aa  174  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.99 
 
 		 1163 aa  173  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  30.32 
 
 		 1364 aa  172  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  46.25 
 
 		 969 aa  172  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.41 
 
 		 1523 aa  172  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  44.63 
 
 		 453 aa  172  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 1557 aa  171  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.33 
 
 		 1547 aa  171  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.18 
 
 		 1256 aa  171  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  38.05 
 
 		 1123 aa  170  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  44.98 
 
 		 1118 aa  170  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  39.49 
 
 		 1401 aa  169  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 268 aa  168  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  39.27 
 
 		 1036 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  39.26 
 
 		 1030 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1026 aa  166  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.31 
 
 		 981 aa  166  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 1186 aa  165  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  44.49 
 
 		 266 aa  164  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 973 aa  164  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  36.83 
 
 		 1121 aa  163  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  42.28 
 
 		 1108 aa  164  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  42.2 
 
 		 1153 aa  163  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 968 aa  163  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.6 
 
 		 1017 aa  162  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  45.28 
 
 		 655 aa  162  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  31.26 
 
 		 1013 aa  161  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  40.41 
 
 		 621 aa  160  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.91 
 
 		 1102 aa  160  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 1046 aa  160  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 983 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  41.53 
 
 		 1003 aa  159  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39.14 
 
 		 1125 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 1020 aa  157  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  42.23 
 
 		 1100 aa  157  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 957 aa  157  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 1010 aa  157  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.87 
 
 		 1193 aa  156  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.33 
 
 		 1103 aa  156  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  41.54 
 
 		 1036 aa  156  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.96 
 
 		 1684 aa  155  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  38.43 
 
 		 388 aa  155  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>