More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3213 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  30.68 
 
 		 1367 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1304 aa  2668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  37.52 
 
 		 1552 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  34.34 
 
 		 1161 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  34.22 
 
 		 1161 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  35.97 
 
 		 1164 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1789 aa  410  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  32.27 
 
 		 1190 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.45 
 
 		 1652 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.09 
 
 		 1831 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.89 
 
 		 1656 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1510 aa  367  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.36 
 
 		 1363 aa  365  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  35.12 
 
 		 1229 aa  362  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  30.9 
 
 		 1661 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.43 
 
 		 1481 aa  362  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  34.49 
 
 		 1553 aa  360  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.27 
 
 		 1163 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.77 
 
 		 1711 aa  355  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.59 
 
 		 1686 aa  342  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  31.76 
 
 		 1766 aa  334  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1477 aa  331  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1858 aa  328  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  33.79 
 
 		 696 aa  324  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.4 
 
 		 1523 aa  323  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.07 
 
 		 1684 aa  323  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.84 
 
 		 1557 aa  322  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  34 
 
 		 1217 aa  318  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.59 
 
 		 1901 aa  318  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.91 
 
 		 924 aa  317  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.21 
 
 		 1236 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 1221 aa  313  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.61 
 
 		 1196 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1714 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.63 
 
 		 1348 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.26 
 
 		 1364 aa  310  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.89 
 
 		 1609 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.24 
 
 		 919 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.03 
 
 		 1357 aa  308  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1176 aa  304  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  32.92 
 
 		 1491 aa  303  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.07 
 
 		 1760 aa  303  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.87 
 
 		 1177 aa  301  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.88 
 
 		 1623 aa  299  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.01 
 
 		 1193 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.98 
 
 		 1599 aa  299  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1807 aa  297  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  32.4 
 
 		 947 aa  295  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.99 
 
 		 1583 aa  288  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  31.35 
 
 		 1474 aa  288  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.18 
 
 		 1262 aa  288  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.62 
 
 		 1454 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.37 
 
 		 1617 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.91 
 
 		 1598 aa  282  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.31 
 
 		 1547 aa  280  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.8 
 
 		 1190 aa  278  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.46 
 
 		 1188 aa  277  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.97 
 
 		 1209 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.95 
 
 		 1626 aa  274  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.55 
 
 		 1211 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.4 
 
 		 1373 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 		 1016 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.11 
 
 		 1213 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.52 
 
 		 1016 aa  268  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.89 
 
 		 1607 aa  267  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.43 
 
 		 1823 aa  266  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.73 
 
 		 740 aa  264  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.01 
 
 		 1247 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1214 aa  259  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.33 
 
 		 930 aa  252  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.04 
 
 		 1443 aa  251  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  34.8 
 
 		 1599 aa  251  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  29 
 
 		 1264 aa  249  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  29 
 
 		 1264 aa  249  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.53 
 
 		 1868 aa  247  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  34.95 
 
 		 1914 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  40.43 
 
 		 344 aa  243  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  36.76 
 
 		 902 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  36.76 
 
 		 902 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  30.89 
 
 		 1188 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  30.23 
 
 		 608 aa  239  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.34 
 
 		 1208 aa  238  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  28.82 
 
 		 1344 aa  235  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  38.91 
 
 		 344 aa  234  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  34.87 
 
 		 781 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  34.93 
 
 		 891 aa  232  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  30.53 
 
 		 1100 aa  231  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1399 aa  228  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.73 
 
 		 1267 aa  227  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 1908 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1041 aa  219  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  25.52 
 
 		 1416 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.58 
 
 		 1240 aa  214  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.23 
 
 		 1280 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.82 
 
 		 1856 aa  212  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 		 1878 aa  209  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 		 1279 aa  208  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1209 aa  207  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  25.81 
 
 		 1279 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  35.6 
 
 		 335 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>