More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3968 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  34.46 
 
 
1809 aa  869    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  30.95 
 
 
1836 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  31.72 
 
 
1871 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  45.03 
 
 
2361 aa  1271    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.11 
 
 
1780 aa  1239    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.08 
 
 
1901 aa  1280    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.9 
 
 
1805 aa  1068    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  42.01 
 
 
1934 aa  1168    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.04 
 
 
1804 aa  1192    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.95 
 
 
2017 aa  1136    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.79 
 
 
1794 aa  1084    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  43.07 
 
 
1850 aa  1266    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.23 
 
 
1797 aa  1186    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.72 
 
 
1795 aa  1144    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.32 
 
 
1808 aa  1140    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  32.23 
 
 
1697 aa  715    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  32.38 
 
 
1712 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.98 
 
 
1668 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  41.51 
 
 
2077 aa  1139    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.77 
 
 
1780 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  44.54 
 
 
1914 aa  1603    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  35.77 
 
 
2303 aa  822    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  37.09 
 
 
1922 aa  959    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  45.37 
 
 
2051 aa  1285    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.92 
 
 
1774 aa  939    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1908 aa  3902    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.71 
 
 
1845 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  34.05 
 
 
1885 aa  781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  35.44 
 
 
2279 aa  855    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
670 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  38.34 
 
 
1811 aa  1055    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  43.15 
 
 
1805 aa  1223    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  45.52 
 
 
1932 aa  1649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.33 
 
 
1822 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  36.12 
 
 
1837 aa  858    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  35.41 
 
 
2272 aa  822    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.98 
 
 
1663 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
1942 aa  1222    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
1644 aa  771    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  34.7 
 
 
2109 aa  807    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.66 
 
 
1739 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  35.64 
 
 
1833 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.57 
 
 
1797 aa  632  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.39 
 
 
1885 aa  583  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.31 
 
 
1832 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.41 
 
 
1685 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  29.27 
 
 
1685 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
1123 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.5 
 
 
1788 aa  513  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  28.12 
 
 
1685 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  29.24 
 
 
1756 aa  466  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  56.95 
 
 
1190 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
1629 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  27.01 
 
 
1682 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
1637 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
1649 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  26.73 
 
 
1682 aa  430  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  54.86 
 
 
1367 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.63 
 
 
1710 aa  423  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
1643 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  54.37 
 
 
781 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 
1636 aa  413  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  53.07 
 
 
1163 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  27.29 
 
 
1060 aa  405  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  54.96 
 
 
891 aa  407  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  28.25 
 
 
1112 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  53.53 
 
 
1177 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  51.11 
 
 
902 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  51.53 
 
 
1164 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
1726 aa  390  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  51.11 
 
 
902 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  27.42 
 
 
1064 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  51.89 
 
 
1176 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  50.93 
 
 
1209 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  50.83 
 
 
1161 aa  377  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  50.83 
 
 
1161 aa  377  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  51.1 
 
 
1477 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  55.18 
 
 
335 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.54 
 
 
1744 aa  354  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  26.12 
 
 
1123 aa  341  7e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.14 
 
 
1748 aa  335  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
1473 aa  317  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
1473 aa  317  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
1473 aa  314  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  25.23 
 
 
1255 aa  288  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  40.11 
 
 
787 aa  257  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  34.62 
 
 
1304 aa  225  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  37.09 
 
 
1214 aa  222  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  37.43 
 
 
376 aa  211  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  22.26 
 
 
900 aa  202  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  26.56 
 
 
1774 aa  194  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  20.88 
 
 
2312 aa  176  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  22.25 
 
 
1015 aa  166  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  21.19 
 
 
1086 aa  158  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
494 aa  156  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  33.33 
 
 
692 aa  155  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
691 aa  155  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.92 
 
 
1131 aa  154  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.48 
 
 
627 aa  151  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
612 aa  149  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>