More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3869 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  57.74 
 
 		 1656 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  39.78 
 
 		 1229 aa  764    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.38 
 
 		 1686 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.57 
 
 		 1240 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  36.74 
 
 		 1236 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.2 
 
 		 1711 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  72.57 
 
 		 1481 aa  2162    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1553 aa  3191    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  70.87 
 
 		 1510 aa  2053    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.45 
 
 		 1760 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.51 
 
 		 1357 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.57 
 
 		 1583 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  50.15 
 
 		 1789 aa  579  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.23 
 
 		 1598 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  46.63 
 
 		 1523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  41.82 
 
 		 1163 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  46.7 
 
 		 1367 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  47.8 
 
 		 1831 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.52 
 
 		 1684 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  32.35 
 
 		 1344 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  46.86 
 
 		 1363 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.06 
 
 		 1547 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  44.54 
 
 		 1652 aa  513  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  46.76 
 
 		 947 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  45.51 
 
 		 1552 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  45.06 
 
 		 696 aa  476  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 1221 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.63 
 
 		 1557 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.91 
 
 		 1868 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  40.99 
 
 		 1454 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  41.41 
 
 		 1193 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  42.55 
 
 		 1217 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  44.91 
 
 		 1364 aa  440  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  42.26 
 
 		 1196 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  41.09 
 
 		 919 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 1334 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  42.61 
 
 		 1766 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  38.07 
 
 		 1188 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 		 1443 aa  406  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.28 
 
 		 1609 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1176 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  42.01 
 
 		 1661 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  33.76 
 
 		 1164 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.15 
 
 		 1262 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  38.49 
 
 		 1474 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1491 aa  397  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.89 
 
 		 924 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1265 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.76 
 
 		 1599 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  37.16 
 
 		 1211 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  38.6 
 
 		 1161 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.35 
 
 		 1398 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  38.6 
 
 		 1161 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  36.77 
 
 		 1714 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  35.91 
 
 		 1190 aa  383  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  41.81 
 
 		 1348 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.57 
 
 		 1623 aa  377  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.02 
 
 		 1626 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.62 
 
 		 1607 aa  376  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1858 aa  376  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  37.06 
 
 		 1901 aa  374  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  37.69 
 
 		 1247 aa  374  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1399 aa  369  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  35.9 
 
 		 1213 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  40 
 
 		 1177 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.17 
 
 		 1208 aa  360  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  36.13 
 
 		 1214 aa  359  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.05 
 
 		 1856 aa  356  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.64 
 
 		 1617 aa  356  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  37.01 
 
 		 1416 aa  352  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  26.51 
 
 		 1699 aa  352  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  26.83 
 
 		 1733 aa  348  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  40.18 
 
 		 1599 aa  342  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1304 aa  342  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  35.02 
 
 		 1807 aa  338  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.55 
 
 		 930 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  36.1 
 
 		 1209 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52.63 
 
 		 740 aa  322  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  37.16 
 
 		 1280 aa  319  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  31.44 
 
 		 1373 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  35.29 
 
 		 1183 aa  314  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.05 
 
 		 1330 aa  313  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.42 
 
 		 1267 aa  311  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  33.6 
 
 		 1411 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  49.54 
 
 		 344 aa  307  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.95 
 
 		 1823 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  35.16 
 
 		 728 aa  301  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  34.13 
 
 		 608 aa  300  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  48.48 
 
 		 344 aa  300  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  32.9 
 
 		 1264 aa  295  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  32.9 
 
 		 1264 aa  295  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1657 aa  288  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  32.12 
 
 		 1242 aa  287  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.33 
 
 		 1100 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 902 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1355 aa  285  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1230 aa  285  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  33.61 
 
 		 505 aa  281  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1209 aa  279  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  30.19 
 
 		 1016 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>