More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3923 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  68.07 
 
 
1599 aa  1779    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  59.7 
 
 
1656 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  36.21 
 
 
1858 aa  802    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.54 
 
 
1652 aa  1144    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  38.76 
 
 
1661 aa  1075    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  41.83 
 
 
1552 aa  1227    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  39.9 
 
 
1714 aa  1075    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
1789 aa  3658    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.77 
 
 
1711 aa  632  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.41 
 
 
1686 aa  609  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  50.15 
 
 
1553 aa  579  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.13 
 
 
1481 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  55.3 
 
 
1510 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  44.55 
 
 
1363 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  43.23 
 
 
1163 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  48.89 
 
 
1523 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  44.83 
 
 
1367 aa  546  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  43.59 
 
 
1176 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  44.41 
 
 
1236 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  39.39 
 
 
1161 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  39.1 
 
 
1161 aa  527  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  40.42 
 
 
1164 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.31 
 
 
1760 aa  509  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  41.93 
 
 
947 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  43.45 
 
 
1221 aa  499  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.15 
 
 
1557 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  40.37 
 
 
1348 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  46.57 
 
 
1364 aa  480  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  38.67 
 
 
1177 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  43.33 
 
 
696 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  45.28 
 
 
1454 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  44.2 
 
 
1357 aa  459  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  40.45 
 
 
1196 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  36.8 
 
 
1766 aa  446  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40.28 
 
 
1193 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  40.2 
 
 
919 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  43.16 
 
 
1443 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  38.67 
 
 
1190 aa  432  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.41 
 
 
1583 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  36.99 
 
 
1373 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  38.56 
 
 
1831 aa  427  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.93 
 
 
1607 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  39.23 
 
 
1474 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.96 
 
 
1868 aa  420  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  37.33 
 
 
1209 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.59 
 
 
1598 aa  420  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  41.72 
 
 
1217 aa  416  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  39.75 
 
 
1188 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.5 
 
 
1609 aa  410  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  42.51 
 
 
1229 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.18 
 
 
1262 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  35.45 
 
 
1016 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  35.45 
 
 
1016 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.77 
 
 
1599 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  38.04 
 
 
1213 aa  394  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  33.61 
 
 
1304 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  38.75 
 
 
1247 aa  390  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.21 
 
 
1626 aa  387  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  36.1 
 
 
1901 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.71 
 
 
1684 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  35.82 
 
 
1264 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  35.82 
 
 
1264 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  32.1 
 
 
1190 aa  377  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.33 
 
 
1623 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.52 
 
 
1547 aa  370  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  37.95 
 
 
608 aa  366  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.73 
 
 
1617 aa  363  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  33.6 
 
 
1211 aa  358  6.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  34.72 
 
 
1807 aa  354  7e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.38 
 
 
924 aa  344  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  34.16 
 
 
1208 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  36.38 
 
 
1416 aa  341  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  36.79 
 
 
565 aa  340  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.58 
 
 
1240 aa  340  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 
1344 aa  338  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  53.61 
 
 
344 aa  336  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  52.71 
 
 
344 aa  329  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.33 
 
 
930 aa  329  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  31.28 
 
 
1279 aa  328  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  31.14 
 
 
1279 aa  325  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1823 aa  314  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.97 
 
 
1267 aa  314  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50.15 
 
 
740 aa  313  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  32.68 
 
 
1214 aa  303  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  27.87 
 
 
1183 aa  302  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  33.73 
 
 
1411 aa  295  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  35.56 
 
 
728 aa  293  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  33 
 
 
1491 aa  289  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  34.23 
 
 
1311 aa  287  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.33 
 
 
1856 aa  284  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.62 
 
 
1100 aa  280  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  32.41 
 
 
1334 aa  280  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.86 
 
 
1398 aa  278  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  29.53 
 
 
1209 aa  275  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  39.04 
 
 
1878 aa  273  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.26 
 
 
677 aa  271  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  28.22 
 
 
1477 aa  268  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.43 
 
 
676 aa  262  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  33.99 
 
 
505 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.62 
 
 
1188 aa  257  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>