More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4789 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.52 
 
 
1583 aa  1305    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.06 
 
 
1267 aa  750    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  48.37 
 
 
972 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.67 
 
 
1547 aa  1305    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.87 
 
 
1598 aa  1332    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.9 
 
 
1684 aa  1152    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  47.69 
 
 
973 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.24 
 
 
1609 aa  1260    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  47.46 
 
 
1046 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.38 
 
 
1626 aa  918    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  100 
 
 
1623 aa  3198    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.84 
 
 
1599 aa  1183    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  47.76 
 
 
1032 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.67 
 
 
1190 aa  820    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  49.6 
 
 
1013 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.58 
 
 
1617 aa  1092    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 
1078 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  48.24 
 
 
969 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  45.9 
 
 
947 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  48.24 
 
 
969 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.62 
 
 
1607 aa  615  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  46.11 
 
 
897 aa  616  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
965 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 
1085 aa  555  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  43 
 
 
1005 aa  551  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  43.1 
 
 
1020 aa  552  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 
1014 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  31.07 
 
 
1553 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.35 
 
 
1481 aa  515  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.29 
 
 
1236 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.2 
 
 
1510 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.61 
 
 
1686 aa  500  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.27 
 
 
1823 aa  499  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.7 
 
 
1711 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  31.2 
 
 
1229 aa  450  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.44 
 
 
1240 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.89 
 
 
1557 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  44 
 
 
1367 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.53 
 
 
1357 aa  446  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  31.93 
 
 
1491 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.25 
 
 
1344 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.52 
 
 
1552 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.58 
 
 
1760 aa  419  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  52.96 
 
 
1398 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  44.5 
 
 
698 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.35 
 
 
1363 aa  394  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  37.33 
 
 
1789 aa  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  37.28 
 
 
1100 aa  360  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.1 
 
 
1652 aa  355  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.32 
 
 
1334 aa  352  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 
1163 aa  350  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  27.82 
 
 
1714 aa  348  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.74 
 
 
1656 aa  344  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.68 
 
 
1211 aa  341  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.7 
 
 
947 aa  338  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.48 
 
 
1196 aa  338  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.3 
 
 
1831 aa  327  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.92 
 
 
1262 aa  327  9e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.83 
 
 
1076 aa  324  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  34.73 
 
 
1523 aa  322  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.22 
 
 
1221 aa  318  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 
1161 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 
1161 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  33.15 
 
 
1364 aa  315  3.9999999999999997e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.58 
 
 
1661 aa  314  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  32.77 
 
 
1416 aa  308  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  24.25 
 
 
1264 aa  307  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  24.25 
 
 
1264 aa  307  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  36.87 
 
 
1766 aa  305  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  32.99 
 
 
1193 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  28.9 
 
 
1183 aa  303  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 
1353 aa  302  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.94 
 
 
1072 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.73 
 
 
1072 aa  299  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
1314 aa  299  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.13 
 
 
696 aa  297  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  32.53 
 
 
1164 aa  295  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 
1190 aa  293  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  34.77 
 
 
1454 aa  289  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.64 
 
 
1399 aa  286  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  35.7 
 
 
1304 aa  284  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  30.96 
 
 
505 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.87 
 
 
1868 aa  277  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 
1474 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.52 
 
 
1901 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.84 
 
 
1348 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  28.54 
 
 
728 aa  273  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.99 
 
 
924 aa  271  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.88 
 
 
1188 aa  271  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.85 
 
 
1265 aa  271  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.77 
 
 
930 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.75 
 
 
1177 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.35 
 
 
1213 aa  267  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.72 
 
 
1176 aa  267  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.8 
 
 
740 aa  266  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.3 
 
 
919 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  31.45 
 
 
1214 aa  257  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  27.79 
 
 
1424 aa  254  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  36.56 
 
 
1599 aa  253  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.22 
 
 
1858 aa  251  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>