More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6431 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  37.43 
 
 		 1831 aa  944    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6430  pentapeptide repeat protein  50.91 
 
 		 998 aa  885    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  37.27 
 
 		 1807 aa  865    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  38.31 
 
 		 1901 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 1766 aa  3489    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  36.8 
 
 		 1789 aa  445  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  43.77 
 
 		 1510 aa  430  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.5 
 
 		 1481 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  42.61 
 
 		 1553 aa  420  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 1557 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  37.75 
 
 		 1367 aa  407  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  37.69 
 
 		 1552 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  38.57 
 
 		 1656 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  36.55 
 
 		 1161 aa  366  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  36.55 
 
 		 1161 aa  365  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.68 
 
 		 1711 aa  364  8e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  37.35 
 
 		 1229 aa  363  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.02 
 
 		 1868 aa  352  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.59 
 
 		 1686 aa  349  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.51 
 
 		 1583 aa  349  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.45 
 
 		 1652 aa  346  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.04 
 
 		 1684 aa  342  5e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  35.02 
 
 		 1714 aa  337  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.11 
 
 		 1609 aa  336  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  35.92 
 
 		 1661 aa  335  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  33.39 
 
 		 1363 aa  332  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  32.3 
 
 		 1163 aa  329  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.43 
 
 		 696 aa  328  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  33.39 
 
 		 1176 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  38.12 
 
 		 1523 aa  326  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  32.87 
 
 		 1164 aa  326  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.61 
 
 		 1443 aa  322  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.03 
 
 		 1236 aa  321  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.59 
 
 		 1598 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  36.2 
 
 		 1364 aa  318  5e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.2 
 
 		 1599 aa  318  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1304 aa  315  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.46 
 
 		 1626 aa  314  7.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.08 
 
 		 1607 aa  313  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  34.55 
 
 		 1193 aa  312  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1474 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 1221 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 		 1760 aa  307  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  37.18 
 
 		 1454 aa  306  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.87 
 
 		 1623 aa  305  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  32.01 
 
 		 1348 aa  305  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  32.5 
 
 		 1177 aa  301  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.64 
 
 		 1547 aa  299  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  37.38 
 
 		 1357 aa  298  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.02 
 
 		 1196 aa  295  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.02 
 
 		 1247 aa  293  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  40.54 
 
 		 1217 aa  292  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  32.88 
 
 		 1188 aa  289  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1858 aa  288  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  28.15 
 
 		 1373 aa  288  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  32.63 
 
 		 1209 aa  287  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.13 
 
 		 1617 aa  279  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  32.79 
 
 		 1491 aa  276  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1190 aa  276  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  35.31 
 
 		 1416 aa  274  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.81 
 
 		 947 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  39.08 
 
 		 1599 aa  272  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.27 
 
 		 1267 aa  269  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  29.3 
 
 		 1190 aa  265  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 		 1213 aa  265  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.41 
 
 		 1262 aa  265  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.94 
 
 		 919 aa  261  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.48 
 
 		 740 aa  261  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  34.85 
 
 		 1211 aa  260  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.32 
 
 		 930 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.89 
 
 		 924 aa  254  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  33.43 
 
 		 1214 aa  251  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.02 
 
 		 1100 aa  250  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 		 1264 aa  244  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 		 1264 aa  244  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 		 1411 aa  241  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  32.22 
 
 		 608 aa  239  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 		 1208 aa  238  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.27 
 
 		 1016 aa  238  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  26.4 
 
 		 1016 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  32.59 
 
 		 505 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  34.46 
 
 		 1280 aa  237  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 		 1188 aa  231  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.96 
 
 		 1240 aa  229  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.03 
 
 		 1072 aa  228  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  41.99 
 
 		 344 aa  227  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  33.89 
 
 		 1183 aa  224  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.79 
 
 		 1072 aa  224  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  28.12 
 
 		 1330 aa  223  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.89 
 
 		 1398 aa  224  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 1076 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.03 
 
 		 1823 aa  223  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  42.3 
 
 		 344 aa  223  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.31 
 
 		 1344 aa  222  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  33.27 
 
 		 1399 aa  217  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  33.15 
 
 		 1484 aa  215  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30.76 
 
 		 728 aa  213  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.96 
 
 		 1242 aa  211  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  30.92 
 
 		 565 aa  211  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 		 1311 aa  206  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>